Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSU0

Rprd1b, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd1bQ9CSU0 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rprd1bQ9CSU0 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rprd1bQ9CSU0 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rprd1bQ9CSU0 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rprd1bQ9CSU0 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rprd1bQ9CSU0 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rprd1bQ9CSU0 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rprd1bQ9CSU0 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Rprd1bQ9CSU0 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Rprd1bQ9CSU0 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rprd1bQ9CSU0 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rprd1bQ9CSU0 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rprd1bQ9CSU0 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rprd1bQ9CSU0 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rprd1bQ9CSU0 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rprd1bQ9CSU0 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rprd1bQ9CSU0 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Rprd1bQ9CSU0 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rprd1bQ9CSU0 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rprd1bQ9CSU0 Dpyd-201ENSMUST00000039177 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rprd1bQ9CSU0 Pitpnm3-202ENSMUST00000108508 6450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rprd1bQ9CSU0 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rprd1bQ9CSU0 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rprd1bQ9CSU0 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rprd1bQ9CSU0 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rprd1bQ9CSU0 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rprd1bQ9CSU0 Pbx1-205ENSMUST00000176540 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rprd1bQ9CSU0 Htr2c-207ENSMUST00000156697 4654 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rprd1bQ9CSU0 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rprd1bQ9CSU0 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rprd1bQ9CSU0 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rprd1bQ9CSU0 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rprd1bQ9CSU0 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rprd1bQ9CSU0 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rprd1bQ9CSU0 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rprd1bQ9CSU0 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rprd1bQ9CSU0 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rprd1bQ9CSU0 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rprd1bQ9CSU0 Gm43868-201ENSMUST00000205187 2114 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Rprd1bQ9CSU0 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rprd1bQ9CSU0 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rprd1bQ9CSU0 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rprd1bQ9CSU0 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rprd1bQ9CSU0 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rprd1bQ9CSU0 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rprd1bQ9CSU0 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rprd1bQ9CSU0 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rprd1bQ9CSU0 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rprd1bQ9CSU0 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rprd1bQ9CSU0 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rprd1bQ9CSU0 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rprd1bQ9CSU0 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Rprd1bQ9CSU0 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rprd1bQ9CSU0 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rprd1bQ9CSU0 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Rprd1bQ9CSU0 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rprd1bQ9CSU0 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Rprd1bQ9CSU0 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Rprd1bQ9CSU0 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Rprd1bQ9CSU0 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Rprd1bQ9CSU0 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rprd1bQ9CSU0 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Rprd1bQ9CSU0 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rprd1bQ9CSU0 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rprd1bQ9CSU0 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rprd1bQ9CSU0 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rprd1bQ9CSU0 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rprd1bQ9CSU0 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rprd1bQ9CSU0 Gm45650-201ENSMUST00000211162 2169 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rprd1bQ9CSU0 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rprd1bQ9CSU0 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rprd1bQ9CSU0 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rprd1bQ9CSU0 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rprd1bQ9CSU0 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rprd1bQ9CSU0 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Rprd1bQ9CSU0 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Rprd1bQ9CSU0 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Rprd1bQ9CSU0 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Rprd1bQ9CSU0 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Rprd1bQ9CSU0 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Rprd1bQ9CSU0 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Rprd1bQ9CSU0 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Rprd1bQ9CSU0 Gm15594-201ENSMUST00000137958 2215 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Rprd1bQ9CSU0 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Rprd1bQ9CSU0 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Rprd1bQ9CSU0 Gm38273-201ENSMUST00000194987 2382 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Rprd1bQ9CSU0 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Rprd1bQ9CSU0 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Rprd1bQ9CSU0 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Rprd1bQ9CSU0 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Rprd1bQ9CSU0 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Rprd1bQ9CSU0 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Rprd1bQ9CSU0 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Rprd1bQ9CSU0 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Rprd1bQ9CSU0 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Rprd1bQ9CSU0 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Rprd1bQ9CSU0 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Rprd1bQ9CSU0 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Rprd1bQ9CSU0 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Rprd1bQ9CSU0 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms