Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQL6

Mrpl35, 39S ribosomal protein L35, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 188 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl35Q9CQL6 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Mrpl35Q9CQL6 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
Mrpl35Q9CQL6 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Mrpl35Q9CQL6 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
Mrpl35Q9CQL6 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Mrpl35Q9CQL6 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Mrpl35Q9CQL6 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Mrpl35Q9CQL6 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Mrpl35Q9CQL6 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Mrpl35Q9CQL6 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Mrpl35Q9CQL6 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Mrpl35Q9CQL6 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Mrpl35Q9CQL6 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Mrpl35Q9CQL6 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Mrpl35Q9CQL6 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Mrpl35Q9CQL6 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Mrpl35Q9CQL6 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Mrpl35Q9CQL6 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Mrpl35Q9CQL6 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Mrpl35Q9CQL6 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Mrpl35Q9CQL6 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Mrpl35Q9CQL6 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Mrpl35Q9CQL6 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Mrpl35Q9CQL6 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Mrpl35Q9CQL6 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Mrpl35Q9CQL6 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Mrpl35Q9CQL6 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Mrpl35Q9CQL6 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Mrpl35Q9CQL6 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Mrpl35Q9CQL6 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Mrpl35Q9CQL6 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Mrpl35Q9CQL6 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Mrpl35Q9CQL6 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Mrpl35Q9CQL6 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Mrpl35Q9CQL6 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Mrpl35Q9CQL6 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Mrpl35Q9CQL6 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Mrpl35Q9CQL6 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Mrpl35Q9CQL6 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Mrpl35Q9CQL6 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Mrpl35Q9CQL6 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Mrpl35Q9CQL6 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Mrpl35Q9CQL6 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Mrpl35Q9CQL6 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Mrpl35Q9CQL6 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Mrpl35Q9CQL6 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Mrpl35Q9CQL6 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Mrpl35Q9CQL6 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Mrpl35Q9CQL6 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Mrpl35Q9CQL6 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Mrpl35Q9CQL6 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Mrpl35Q9CQL6 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Mrpl35Q9CQL6 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Mrpl35Q9CQL6 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Mrpl35Q9CQL6 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Mrpl35Q9CQL6 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Mrpl35Q9CQL6 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Mrpl35Q9CQL6 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Mrpl35Q9CQL6 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Mrpl35Q9CQL6 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Mrpl35Q9CQL6 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Mrpl35Q9CQL6 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Mrpl35Q9CQL6 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Mrpl35Q9CQL6 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Mrpl35Q9CQL6 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Mrpl35Q9CQL6 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Mrpl35Q9CQL6 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Mrpl35Q9CQL6 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Mrpl35Q9CQL6 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Mrpl35Q9CQL6 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Mrpl35Q9CQL6 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Mrpl35Q9CQL6 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Mrpl35Q9CQL6 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Mrpl35Q9CQL6 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Mrpl35Q9CQL6 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Mrpl35Q9CQL6 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Mrpl35Q9CQL6 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Mrpl35Q9CQL6 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Mrpl35Q9CQL6 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Mrpl35Q9CQL6 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Mrpl35Q9CQL6 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Mrpl35Q9CQL6 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Mrpl35Q9CQL6 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Mrpl35Q9CQL6 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Mrpl35Q9CQL6 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Mrpl35Q9CQL6 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Mrpl35Q9CQL6 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Mrpl35Q9CQL6 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Mrpl35Q9CQL6 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Mrpl35Q9CQL6 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Mrpl35Q9CQL6 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Mrpl35Q9CQL6 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Mrpl35Q9CQL6 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Mrpl35Q9CQL6 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Mrpl35Q9CQL6 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Mrpl35Q9CQL6 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Mrpl35Q9CQL6 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Mrpl35Q9CQL6 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Mrpl35Q9CQL6 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Mrpl35Q9CQL6 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.3 ms