Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ10

Chmp3, Charged multivesicular body protein 3, mousemouse

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Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp3Q9CQ10 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Chmp3Q9CQ10 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Chmp3Q9CQ10 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Chmp3Q9CQ10 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Chmp3Q9CQ10 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Chmp3Q9CQ10 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Chmp3Q9CQ10 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Chmp3Q9CQ10 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Chmp3Q9CQ10 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Chmp3Q9CQ10 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Chmp3Q9CQ10 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Chmp3Q9CQ10 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Chmp3Q9CQ10 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Chmp3Q9CQ10 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Chmp3Q9CQ10 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Chmp3Q9CQ10 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Chmp3Q9CQ10 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Chmp3Q9CQ10 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Chmp3Q9CQ10 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Chmp3Q9CQ10 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Chmp3Q9CQ10 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Chmp3Q9CQ10 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Chmp3Q9CQ10 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Chmp3Q9CQ10 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Chmp3Q9CQ10 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Chmp3Q9CQ10 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Chmp3Q9CQ10 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Chmp3Q9CQ10 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Chmp3Q9CQ10 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Chmp3Q9CQ10 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Chmp3Q9CQ10 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Chmp3Q9CQ10 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Chmp3Q9CQ10 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Chmp3Q9CQ10 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Chmp3Q9CQ10 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Chmp3Q9CQ10 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Chmp3Q9CQ10 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Chmp3Q9CQ10 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Chmp3Q9CQ10 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Chmp3Q9CQ10 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Chmp3Q9CQ10 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Chmp3Q9CQ10 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Chmp3Q9CQ10 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Chmp3Q9CQ10 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Chmp3Q9CQ10 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Chmp3Q9CQ10 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Chmp3Q9CQ10 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Chmp3Q9CQ10 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Chmp3Q9CQ10 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Chmp3Q9CQ10 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Chmp3Q9CQ10 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Chmp3Q9CQ10 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Chmp3Q9CQ10 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Chmp3Q9CQ10 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Chmp3Q9CQ10 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
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Chmp3Q9CQ10 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Chmp3Q9CQ10 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Chmp3Q9CQ10 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Chmp3Q9CQ10 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Chmp3Q9CQ10 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Chmp3Q9CQ10 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Chmp3Q9CQ10 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Chmp3Q9CQ10 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Chmp3Q9CQ10 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Chmp3Q9CQ10 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Chmp3Q9CQ10 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Chmp3Q9CQ10 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Chmp3Q9CQ10 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Chmp3Q9CQ10 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Chmp3Q9CQ10 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Chmp3Q9CQ10 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Chmp3Q9CQ10 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Chmp3Q9CQ10 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Chmp3Q9CQ10 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Chmp3Q9CQ10 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Chmp3Q9CQ10 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Chmp3Q9CQ10 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Chmp3Q9CQ10 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Chmp3Q9CQ10 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Chmp3Q9CQ10 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Chmp3Q9CQ10 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Chmp3Q9CQ10 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Chmp3Q9CQ10 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Chmp3Q9CQ10 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Chmp3Q9CQ10 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Chmp3Q9CQ10 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Chmp3Q9CQ10 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Chmp3Q9CQ10 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Chmp3Q9CQ10 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Chmp3Q9CQ10 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Chmp3Q9CQ10 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Chmp3Q9CQ10 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Chmp3Q9CQ10 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Chmp3Q9CQ10 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Chmp3Q9CQ10 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Chmp3Q9CQ10 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Chmp3Q9CQ10 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Chmp3Q9CQ10 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Chmp3Q9CQ10 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
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