Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY66

KDM5D, Lysine-specific demethylase 5D, humanhuman

Predictions only

Length 1,539 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5DQ9BY66 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
KDM5DQ9BY66 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
KDM5DQ9BY66 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
KDM5DQ9BY66 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
KDM5DQ9BY66 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
KDM5DQ9BY66 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
KDM5DQ9BY66 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
KDM5DQ9BY66 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
KDM5DQ9BY66 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
KDM5DQ9BY66 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
KDM5DQ9BY66 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
KDM5DQ9BY66 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
KDM5DQ9BY66 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC23.85■■□□□ 1.41
KDM5DQ9BY66 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
KDM5DQ9BY66 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
KDM5DQ9BY66 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC23.85■■□□□ 1.41
KDM5DQ9BY66 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
KDM5DQ9BY66 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
KDM5DQ9BY66 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
KDM5DQ9BY66 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
KDM5DQ9BY66 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC23.85■■□□□ 1.41
KDM5DQ9BY66 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
KDM5DQ9BY66 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.85■■□□□ 1.41
KDM5DQ9BY66 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
KDM5DQ9BY66 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
KDM5DQ9BY66 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
KDM5DQ9BY66 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
KDM5DQ9BY66 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
KDM5DQ9BY66 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
KDM5DQ9BY66 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
KDM5DQ9BY66 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
KDM5DQ9BY66 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
KDM5DQ9BY66 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
KDM5DQ9BY66 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
KDM5DQ9BY66 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
KDM5DQ9BY66 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
KDM5DQ9BY66 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
KDM5DQ9BY66 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
KDM5DQ9BY66 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
KDM5DQ9BY66 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
KDM5DQ9BY66 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
KDM5DQ9BY66 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
KDM5DQ9BY66 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
KDM5DQ9BY66 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
KDM5DQ9BY66 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
KDM5DQ9BY66 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
KDM5DQ9BY66 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
KDM5DQ9BY66 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
KDM5DQ9BY66 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
KDM5DQ9BY66 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
KDM5DQ9BY66 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
KDM5DQ9BY66 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
KDM5DQ9BY66 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
KDM5DQ9BY66 BCYRN1-201ENST00000418539 200 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
KDM5DQ9BY66 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
KDM5DQ9BY66 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
KDM5DQ9BY66 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
KDM5DQ9BY66 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
KDM5DQ9BY66 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
KDM5DQ9BY66 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
KDM5DQ9BY66 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
KDM5DQ9BY66 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
KDM5DQ9BY66 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
KDM5DQ9BY66 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
KDM5DQ9BY66 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
KDM5DQ9BY66 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
KDM5DQ9BY66 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
KDM5DQ9BY66 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
KDM5DQ9BY66 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
KDM5DQ9BY66 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
KDM5DQ9BY66 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
KDM5DQ9BY66 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
KDM5DQ9BY66 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
KDM5DQ9BY66 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
KDM5DQ9BY66 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
KDM5DQ9BY66 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
KDM5DQ9BY66 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
KDM5DQ9BY66 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
KDM5DQ9BY66 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
KDM5DQ9BY66 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
KDM5DQ9BY66 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
KDM5DQ9BY66 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
KDM5DQ9BY66 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
KDM5DQ9BY66 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC23.83■■□□□ 1.41
KDM5DQ9BY66 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
KDM5DQ9BY66 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
KDM5DQ9BY66 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
KDM5DQ9BY66 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
KDM5DQ9BY66 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
KDM5DQ9BY66 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC23.83■■□□□ 1.4
KDM5DQ9BY66 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
KDM5DQ9BY66 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
KDM5DQ9BY66 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
KDM5DQ9BY66 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
KDM5DQ9BY66 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
KDM5DQ9BY66 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
KDM5DQ9BY66 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
KDM5DQ9BY66 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
KDM5DQ9BY66 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
KDM5DQ9BY66 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms