Protein–RNA interactions for Protein: Q99PA7

4930550L24Rik, MCG117379, mousemouse

Predictions only

Length 320 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930550L24RikQ99PA7 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
4930550L24RikQ99PA7 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
4930550L24RikQ99PA7 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
4930550L24RikQ99PA7 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
4930550L24RikQ99PA7 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
4930550L24RikQ99PA7 Pex26-202ENSMUST00000118234 3778 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
4930550L24RikQ99PA7 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
4930550L24RikQ99PA7 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
4930550L24RikQ99PA7 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
4930550L24RikQ99PA7 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
4930550L24RikQ99PA7 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
4930550L24RikQ99PA7 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
4930550L24RikQ99PA7 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
4930550L24RikQ99PA7 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
4930550L24RikQ99PA7 Lypd6-202ENSMUST00000112712 3495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
4930550L24RikQ99PA7 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
4930550L24RikQ99PA7 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
4930550L24RikQ99PA7 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
4930550L24RikQ99PA7 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
4930550L24RikQ99PA7 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
4930550L24RikQ99PA7 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
4930550L24RikQ99PA7 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
4930550L24RikQ99PA7 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
4930550L24RikQ99PA7 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
4930550L24RikQ99PA7 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
4930550L24RikQ99PA7 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
4930550L24RikQ99PA7 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
4930550L24RikQ99PA7 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
4930550L24RikQ99PA7 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
4930550L24RikQ99PA7 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
4930550L24RikQ99PA7 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
4930550L24RikQ99PA7 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
4930550L24RikQ99PA7 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
4930550L24RikQ99PA7 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
4930550L24RikQ99PA7 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
4930550L24RikQ99PA7 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
4930550L24RikQ99PA7 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
4930550L24RikQ99PA7 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
4930550L24RikQ99PA7 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
4930550L24RikQ99PA7 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
4930550L24RikQ99PA7 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
4930550L24RikQ99PA7 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
4930550L24RikQ99PA7 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
4930550L24RikQ99PA7 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
4930550L24RikQ99PA7 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
4930550L24RikQ99PA7 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
4930550L24RikQ99PA7 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
4930550L24RikQ99PA7 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
4930550L24RikQ99PA7 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
4930550L24RikQ99PA7 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
4930550L24RikQ99PA7 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
4930550L24RikQ99PA7 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
4930550L24RikQ99PA7 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
4930550L24RikQ99PA7 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
4930550L24RikQ99PA7 Wdr4-207ENSMUST00000171171 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
4930550L24RikQ99PA7 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
4930550L24RikQ99PA7 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
4930550L24RikQ99PA7 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
4930550L24RikQ99PA7 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
4930550L24RikQ99PA7 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
4930550L24RikQ99PA7 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
4930550L24RikQ99PA7 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
4930550L24RikQ99PA7 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
4930550L24RikQ99PA7 Emilin1-201ENSMUST00000031055 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
4930550L24RikQ99PA7 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
4930550L24RikQ99PA7 Trim55-201ENSMUST00000029139 2595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
4930550L24RikQ99PA7 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
4930550L24RikQ99PA7 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
4930550L24RikQ99PA7 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
4930550L24RikQ99PA7 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
4930550L24RikQ99PA7 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
4930550L24RikQ99PA7 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
4930550L24RikQ99PA7 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
4930550L24RikQ99PA7 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
4930550L24RikQ99PA7 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
4930550L24RikQ99PA7 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
4930550L24RikQ99PA7 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
4930550L24RikQ99PA7 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
4930550L24RikQ99PA7 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
4930550L24RikQ99PA7 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
4930550L24RikQ99PA7 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
4930550L24RikQ99PA7 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
4930550L24RikQ99PA7 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
4930550L24RikQ99PA7 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
4930550L24RikQ99PA7 Pabpc4-204ENSMUST00000106243 3111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
4930550L24RikQ99PA7 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
4930550L24RikQ99PA7 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
4930550L24RikQ99PA7 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
4930550L24RikQ99PA7 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
4930550L24RikQ99PA7 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
4930550L24RikQ99PA7 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
4930550L24RikQ99PA7 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
4930550L24RikQ99PA7 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
4930550L24RikQ99PA7 Asb3-202ENSMUST00000117883 2509 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
4930550L24RikQ99PA7 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
4930550L24RikQ99PA7 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
4930550L24RikQ99PA7 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
4930550L24RikQ99PA7 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
4930550L24RikQ99PA7 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
4930550L24RikQ99PA7 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms