Protein–RNA interactions for Protein: Q99KF1

Tmed9, Transmembrane emp24 domain-containing protein 9, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 235 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed9Q99KF1 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Tmed9Q99KF1 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Tmed9Q99KF1 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Tmed9Q99KF1 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Tmed9Q99KF1 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Tmed9Q99KF1 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Tmed9Q99KF1 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Tmed9Q99KF1 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Tmed9Q99KF1 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Tmed9Q99KF1 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Tmed9Q99KF1 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tmed9Q99KF1 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tmed9Q99KF1 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tmed9Q99KF1 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tmed9Q99KF1 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tmed9Q99KF1 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tmed9Q99KF1 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tmed9Q99KF1 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tmed9Q99KF1 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tmed9Q99KF1 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tmed9Q99KF1 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tmed9Q99KF1 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tmed9Q99KF1 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tmed9Q99KF1 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Tmed9Q99KF1 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Tmed9Q99KF1 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tmed9Q99KF1 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Tmed9Q99KF1 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tmed9Q99KF1 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Tmed9Q99KF1 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tmed9Q99KF1 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Tmed9Q99KF1 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tmed9Q99KF1 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tmed9Q99KF1 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tmed9Q99KF1 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tmed9Q99KF1 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tmed9Q99KF1 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tmed9Q99KF1 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tmed9Q99KF1 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tmed9Q99KF1 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tmed9Q99KF1 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tmed9Q99KF1 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tmed9Q99KF1 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tmed9Q99KF1 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tmed9Q99KF1 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tmed9Q99KF1 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tmed9Q99KF1 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tmed9Q99KF1 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tmed9Q99KF1 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tmed9Q99KF1 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Tmed9Q99KF1 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tmed9Q99KF1 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tmed9Q99KF1 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tmed9Q99KF1 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tmed9Q99KF1 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tmed9Q99KF1 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Tmed9Q99KF1 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tmed9Q99KF1 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tmed9Q99KF1 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tmed9Q99KF1 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tmed9Q99KF1 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tmed9Q99KF1 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tmed9Q99KF1 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tmed9Q99KF1 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tmed9Q99KF1 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tmed9Q99KF1 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tmed9Q99KF1 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tmed9Q99KF1 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tmed9Q99KF1 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Tmed9Q99KF1 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tmed9Q99KF1 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tmed9Q99KF1 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tmed9Q99KF1 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tmed9Q99KF1 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Tmed9Q99KF1 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tmed9Q99KF1 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tmed9Q99KF1 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tmed9Q99KF1 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tmed9Q99KF1 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tmed9Q99KF1 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tmed9Q99KF1 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tmed9Q99KF1 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tmed9Q99KF1 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tmed9Q99KF1 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tmed9Q99KF1 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tmed9Q99KF1 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Tmed9Q99KF1 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tmed9Q99KF1 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tmed9Q99KF1 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Tmed9Q99KF1 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tmed9Q99KF1 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tmed9Q99KF1 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Tmed9Q99KF1 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Tmed9Q99KF1 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Tmed9Q99KF1 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Tmed9Q99KF1 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Tmed9Q99KF1 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Tmed9Q99KF1 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Tmed9Q99KF1 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Tmed9Q99KF1 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
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