Protein–RNA interactions for Protein: Q99JY6

Higd1b, HIG1 domain family member 1B, mousemouse

Predictions only

Length 98 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Higd1bQ99JY6 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Higd1bQ99JY6 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Higd1bQ99JY6 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Higd1bQ99JY6 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Higd1bQ99JY6 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Higd1bQ99JY6 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Higd1bQ99JY6 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Higd1bQ99JY6 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Higd1bQ99JY6 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Higd1bQ99JY6 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Higd1bQ99JY6 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Higd1bQ99JY6 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Higd1bQ99JY6 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Higd1bQ99JY6 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Higd1bQ99JY6 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Higd1bQ99JY6 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Higd1bQ99JY6 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Higd1bQ99JY6 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Higd1bQ99JY6 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Higd1bQ99JY6 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Higd1bQ99JY6 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Higd1bQ99JY6 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Higd1bQ99JY6 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Higd1bQ99JY6 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Higd1bQ99JY6 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Higd1bQ99JY6 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Higd1bQ99JY6 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Higd1bQ99JY6 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Higd1bQ99JY6 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Higd1bQ99JY6 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Higd1bQ99JY6 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Higd1bQ99JY6 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Higd1bQ99JY6 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Higd1bQ99JY6 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Higd1bQ99JY6 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Higd1bQ99JY6 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Higd1bQ99JY6 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Higd1bQ99JY6 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Higd1bQ99JY6 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Higd1bQ99JY6 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Higd1bQ99JY6 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Higd1bQ99JY6 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Higd1bQ99JY6 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Higd1bQ99JY6 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Higd1bQ99JY6 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Higd1bQ99JY6 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Higd1bQ99JY6 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Higd1bQ99JY6 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Higd1bQ99JY6 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Higd1bQ99JY6 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Higd1bQ99JY6 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Higd1bQ99JY6 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Higd1bQ99JY6 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Higd1bQ99JY6 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Higd1bQ99JY6 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Higd1bQ99JY6 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Higd1bQ99JY6 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Higd1bQ99JY6 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Higd1bQ99JY6 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Higd1bQ99JY6 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Higd1bQ99JY6 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Higd1bQ99JY6 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Higd1bQ99JY6 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Higd1bQ99JY6 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Higd1bQ99JY6 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Higd1bQ99JY6 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Higd1bQ99JY6 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Higd1bQ99JY6 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Higd1bQ99JY6 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Higd1bQ99JY6 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Higd1bQ99JY6 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Higd1bQ99JY6 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Higd1bQ99JY6 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Higd1bQ99JY6 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Higd1bQ99JY6 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Higd1bQ99JY6 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Higd1bQ99JY6 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Higd1bQ99JY6 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Higd1bQ99JY6 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Higd1bQ99JY6 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Higd1bQ99JY6 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Higd1bQ99JY6 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Higd1bQ99JY6 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Higd1bQ99JY6 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Higd1bQ99JY6 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Higd1bQ99JY6 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Higd1bQ99JY6 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Higd1bQ99JY6 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Higd1bQ99JY6 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Higd1bQ99JY6 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Higd1bQ99JY6 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Higd1bQ99JY6 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Higd1bQ99JY6 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Higd1bQ99JY6 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Higd1bQ99JY6 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Higd1bQ99JY6 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Higd1bQ99JY6 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Higd1bQ99JY6 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Higd1bQ99JY6 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Higd1bQ99JY6 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms