Protein–RNA interactions for Protein: Q925N4

Cldn16, Claudin-16, mousemouse

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Length 235 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn16Q925N4 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Cldn16Q925N4 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cldn16Q925N4 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cldn16Q925N4 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cldn16Q925N4 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cldn16Q925N4 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cldn16Q925N4 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cldn16Q925N4 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cldn16Q925N4 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cldn16Q925N4 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cldn16Q925N4 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cldn16Q925N4 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cldn16Q925N4 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cldn16Q925N4 Zfp516-202ENSMUST00000171238 7725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cldn16Q925N4 Zfp516-201ENSMUST00000071233 7703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cldn16Q925N4 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cldn16Q925N4 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cldn16Q925N4 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cldn16Q925N4 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cldn16Q925N4 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Cldn16Q925N4 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cldn16Q925N4 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cldn16Q925N4 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cldn16Q925N4 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cldn16Q925N4 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cldn16Q925N4 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cldn16Q925N4 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cldn16Q925N4 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cldn16Q925N4 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cldn16Q925N4 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cldn16Q925N4 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cldn16Q925N4 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cldn16Q925N4 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cldn16Q925N4 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cldn16Q925N4 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cldn16Q925N4 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cldn16Q925N4 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Cldn16Q925N4 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cldn16Q925N4 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cldn16Q925N4 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cldn16Q925N4 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cldn16Q925N4 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cldn16Q925N4 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cldn16Q925N4 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Cldn16Q925N4 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Cldn16Q925N4 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Cldn16Q925N4 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cldn16Q925N4 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cldn16Q925N4 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cldn16Q925N4 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cldn16Q925N4 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cldn16Q925N4 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cldn16Q925N4 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cldn16Q925N4 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cldn16Q925N4 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cldn16Q925N4 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cldn16Q925N4 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cldn16Q925N4 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cldn16Q925N4 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cldn16Q925N4 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cldn16Q925N4 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cldn16Q925N4 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cldn16Q925N4 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cldn16Q925N4 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cldn16Q925N4 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cldn16Q925N4 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cldn16Q925N4 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cldn16Q925N4 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cldn16Q925N4 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cldn16Q925N4 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cldn16Q925N4 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cldn16Q925N4 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cldn16Q925N4 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cldn16Q925N4 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cldn16Q925N4 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cldn16Q925N4 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cldn16Q925N4 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Cldn16Q925N4 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cldn16Q925N4 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cldn16Q925N4 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cldn16Q925N4 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cldn16Q925N4 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cldn16Q925N4 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cldn16Q925N4 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cldn16Q925N4 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cldn16Q925N4 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cldn16Q925N4 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cldn16Q925N4 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cldn16Q925N4 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cldn16Q925N4 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cldn16Q925N4 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Cldn16Q925N4 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cldn16Q925N4 Madd-210ENSMUST00000111372 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cldn16Q925N4 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cldn16Q925N4 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cldn16Q925N4 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cldn16Q925N4 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Cldn16Q925N4 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cldn16Q925N4 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Cldn16Q925N4 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
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