Protein–RNA interactions for Protein: Q920D3

Med28, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 28, mousemouse

Predictions only

Length 178 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med28Q920D3 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Med28Q920D3 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Med28Q920D3 Vmn1r45-202ENSMUST00000226167 2893 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Med28Q920D3 Stat3-202ENSMUST00000103114 6042 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Med28Q920D3 Nek4-201ENSMUST00000050171 2793 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Med28Q920D3 Rbm47-202ENSMUST00000094757 4643 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Med28Q920D3 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Med28Q920D3 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Med28Q920D3 Lrfn5-201ENSMUST00000055815 4410 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Med28Q920D3 Pabpc4-204ENSMUST00000106243 3111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Med28Q920D3 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Med28Q920D3 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Med28Q920D3 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Med28Q920D3 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Med28Q920D3 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Med28Q920D3 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Med28Q920D3 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Med28Q920D3 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Med28Q920D3 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Med28Q920D3 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Med28Q920D3 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Med28Q920D3 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Med28Q920D3 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Med28Q920D3 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Med28Q920D3 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Med28Q920D3 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Med28Q920D3 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Med28Q920D3 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Med28Q920D3 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Med28Q920D3 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Med28Q920D3 Gm10419-202ENSMUST00000196693 2530 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Med28Q920D3 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Med28Q920D3 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Med28Q920D3 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Med28Q920D3 Esrp1-204ENSMUST00000108313 3696 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Med28Q920D3 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Med28Q920D3 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Med28Q920D3 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Med28Q920D3 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Med28Q920D3 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Med28Q920D3 Gdpd2-201ENSMUST00000019503 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Med28Q920D3 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Med28Q920D3 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Med28Q920D3 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Med28Q920D3 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Med28Q920D3 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Med28Q920D3 Hcn1-201ENSMUST00000006991 14141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Med28Q920D3 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Med28Q920D3 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Med28Q920D3 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Med28Q920D3 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Med28Q920D3 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Med28Q920D3 Olfml3-201ENSMUST00000029440 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Med28Q920D3 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Med28Q920D3 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Med28Q920D3 Pcdhgb5-201ENSMUST00000192535 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Med28Q920D3 G6pdx-201ENSMUST00000004327 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Med28Q920D3 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Med28Q920D3 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Med28Q920D3 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Med28Q920D3 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Med28Q920D3 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Med28Q920D3 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Med28Q920D3 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Med28Q920D3 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Med28Q920D3 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Med28Q920D3 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Med28Q920D3 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Med28Q920D3 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Med28Q920D3 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Med28Q920D3 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Med28Q920D3 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Med28Q920D3 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Med28Q920D3 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Med28Q920D3 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Med28Q920D3 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Med28Q920D3 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Med28Q920D3 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Med28Q920D3 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Med28Q920D3 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Med28Q920D3 Hdc-201ENSMUST00000028838 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Med28Q920D3 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Med28Q920D3 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Med28Q920D3 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Med28Q920D3 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Med28Q920D3 Vamp1-201ENSMUST00000032487 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Med28Q920D3 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Med28Q920D3 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Med28Q920D3 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Med28Q920D3 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Med28Q920D3 Slc9a1-201ENSMUST00000030669 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Med28Q920D3 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Med28Q920D3 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Med28Q920D3 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Med28Q920D3 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Med28Q920D3 Arhgef28-201ENSMUST00000109426 5387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Med28Q920D3 Gm26584-201ENSMUST00000180551 3216 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Med28Q920D3 AC164441.2-201ENSMUST00000220818 2746 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Med28Q920D3 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Med28Q920D3 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.4 ms