Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHJ7

Ppargc1b, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator 1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,014 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm14791-201ENSMUST00000119061 1166 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Ppargc1bQ8VHJ7 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ppargc1bQ8VHJ7 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm29043-201ENSMUST00000186371 623 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Ppargc1bQ8VHJ7 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ppargc1bQ8VHJ7 Vmn1r67-201ENSMUST00000055964 999 ntAPPRIS P2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm17415-201ENSMUST00000096427 789 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Ppargc1bQ8VHJ7 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ppargc1bQ8VHJ7 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ppargc1bQ8VHJ7 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ppargc1bQ8VHJ7 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ppargc1bQ8VHJ7 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ppargc1bQ8VHJ7 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ppargc1bQ8VHJ7 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ppargc1bQ8VHJ7 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ppargc1bQ8VHJ7 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ppargc1bQ8VHJ7 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ppargc1bQ8VHJ7 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ppargc1bQ8VHJ7 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ppargc1bQ8VHJ7 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ppargc1bQ8VHJ7 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ppargc1bQ8VHJ7 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ppargc1bQ8VHJ7 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ppargc1bQ8VHJ7 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ppargc1bQ8VHJ7 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ppargc1bQ8VHJ7 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ppargc1bQ8VHJ7 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ppargc1bQ8VHJ7 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ppargc1bQ8VHJ7 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ppargc1bQ8VHJ7 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ppargc1bQ8VHJ7 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ppargc1bQ8VHJ7 4930471M09Rik-201ENSMUST00000181849 1112 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ppargc1bQ8VHJ7 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ppargc1bQ8VHJ7 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ppargc1bQ8VHJ7 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ppargc1bQ8VHJ7 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm45885-202ENSMUST00000211520 1383 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Ppargc1bQ8VHJ7 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ppargc1bQ8VHJ7 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ppargc1bQ8VHJ7 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ppargc1bQ8VHJ7 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ppargc1bQ8VHJ7 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ppargc1bQ8VHJ7 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ppargc1bQ8VHJ7 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ppargc1bQ8VHJ7 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm12022-201ENSMUST00000143311 1340 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Ppargc1bQ8VHJ7 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ppargc1bQ8VHJ7 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ppargc1bQ8VHJ7 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ppargc1bQ8VHJ7 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ppargc1bQ8VHJ7 Tfpi-207ENSMUST00000111722 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Ppargc1bQ8VHJ7 Fabp12-202ENSMUST00000117917 648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ppargc1bQ8VHJ7 Vmn1r5-201ENSMUST00000164307 1056 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm17727-201ENSMUST00000171898 643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ppargc1bQ8VHJ7 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ppargc1bQ8VHJ7 Vmn1r-ps28-201ENSMUST00000174767 942 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Ppargc1bQ8VHJ7 Tceanc-203ENSMUST00000180322 1080 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm20854-202ENSMUST00000181549 1156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ppargc1bQ8VHJ7 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm20812-202ENSMUST00000189550 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Ppargc1bQ8VHJ7 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ppargc1bQ8VHJ7 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Ppargc1bQ8VHJ7 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ppargc1bQ8VHJ7 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ppargc1bQ8VHJ7 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ppargc1bQ8VHJ7 Olfr1428-202ENSMUST00000208391 1368 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm12532-201ENSMUST00000148448 2684 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ppargc1bQ8VHJ7 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ppargc1bQ8VHJ7 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ppargc1bQ8VHJ7 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ppargc1bQ8VHJ7 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm31218-201ENSMUST00000221181 1498 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ppargc1bQ8VHJ7 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ppargc1bQ8VHJ7 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ppargc1bQ8VHJ7 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ppargc1bQ8VHJ7 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ppargc1bQ8VHJ7 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ppargc1bQ8VHJ7 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm12978-201ENSMUST00000121250 522 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm12670-201ENSMUST00000123606 576 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ppargc1bQ8VHJ7 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ppargc1bQ8VHJ7 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm15597-201ENSMUST00000145924 1050 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ppargc1bQ8VHJ7 Lyzl4os-202ENSMUST00000156364 726 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ppargc1bQ8VHJ7 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ppargc1bQ8VHJ7 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ppargc1bQ8VHJ7 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ppargc1bQ8VHJ7 Olfr1449-204ENSMUST00000215325 1149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ppargc1bQ8VHJ7 Hmgb1-ps11-201ENSMUST00000221749 621 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms