Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDP2

UPF0428 protein CXorf56 homolog, mousemouse

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Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8VDP2 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q8VDP2 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q8VDP2 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q8VDP2 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Q8VDP2 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q8VDP2 Sass6-204ENSMUST00000197335 2458 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q8VDP2 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q8VDP2 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q8VDP2 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q8VDP2 Nr5a1-201ENSMUST00000028084 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q8VDP2 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q8VDP2 Itgb4-204ENSMUST00000106460 5919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q8VDP2 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q8VDP2 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q8VDP2 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q8VDP2 Tiparp-201ENSMUST00000047906 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q8VDP2 Nop14-201ENSMUST00000041364 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q8VDP2 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q8VDP2 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q8VDP2 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q8VDP2 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q8VDP2 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q8VDP2 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q8VDP2 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q8VDP2 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q8VDP2 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q8VDP2 Irak2-201ENSMUST00000059286 3196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q8VDP2 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q8VDP2 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q8VDP2 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q8VDP2 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q8VDP2 Hdac7-205ENSMUST00000118294 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q8VDP2 Grhl2-201ENSMUST00000022895 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q8VDP2 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q8VDP2 Hdac7-201ENSMUST00000079838 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q8VDP2 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q8VDP2 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q8VDP2 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q8VDP2 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q8VDP2 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q8VDP2 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q8VDP2 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q8VDP2 Pla2g4b-201ENSMUST00000126150 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q8VDP2 Arfgap2-201ENSMUST00000028691 2791 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q8VDP2 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q8VDP2 Gm14137-201ENSMUST00000069711 3067 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q8VDP2 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q8VDP2 Tfdp2-204ENSMUST00000179065 2213 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q8VDP2 Mast4-207ENSMUST00000167058 10636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q8VDP2 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q8VDP2 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q8VDP2 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q8VDP2 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q8VDP2 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q8VDP2 Spata2-201ENSMUST00000057627 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q8VDP2 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q8VDP2 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q8VDP2 Limk2-201ENSMUST00000101638 3514 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q8VDP2 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q8VDP2 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q8VDP2 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q8VDP2 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q8VDP2 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q8VDP2 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q8VDP2 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q8VDP2 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q8VDP2 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q8VDP2 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q8VDP2 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q8VDP2 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q8VDP2 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q8VDP2 Gm16083-201ENSMUST00000125681 2547 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q8VDP2 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q8VDP2 Dusp6-204ENSMUST00000220291 2359 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q8VDP2 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q8VDP2 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q8VDP2 Rsad1-201ENSMUST00000040487 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q8VDP2 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q8VDP2 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q8VDP2 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q8VDP2 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q8VDP2 Wdr36-201ENSMUST00000053663 3281 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Q8VDP2 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Q8VDP2 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Q8VDP2 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Q8VDP2 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC13.08□□□□□ -0.31
Q8VDP2 Epha5-206ENSMUST00000113406 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Q8VDP2 Fubp1-209ENSMUST00000198227 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q8VDP2 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q8VDP2 Gmppb-202ENSMUST00000112295 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q8VDP2 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q8VDP2 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q8VDP2 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q8VDP2 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q8VDP2 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q8VDP2 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q8VDP2 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q8VDP2 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q8VDP2 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q8VDP2 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
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