Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDB9

Slc6a20a, Sodium- and chloride-dependent transporter XTRP3A, mousemouse

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Length 592 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc6a20aQ8VDB9 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Slc6a20aQ8VDB9 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Slc6a20aQ8VDB9 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Slc6a20aQ8VDB9 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Slc6a20aQ8VDB9 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Slc6a20aQ8VDB9 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Slc6a20aQ8VDB9 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Slc6a20aQ8VDB9 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Slc6a20aQ8VDB9 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Slc6a20aQ8VDB9 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Slc6a20aQ8VDB9 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Slc6a20aQ8VDB9 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Slc6a20aQ8VDB9 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Slc6a20aQ8VDB9 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Slc6a20aQ8VDB9 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Slc6a20aQ8VDB9 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Slc6a20aQ8VDB9 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Slc6a20aQ8VDB9 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Slc6a20aQ8VDB9 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Slc6a20aQ8VDB9 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Slc6a20aQ8VDB9 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Slc6a20aQ8VDB9 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Slc6a20aQ8VDB9 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Slc6a20aQ8VDB9 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Slc6a20aQ8VDB9 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Slc6a20aQ8VDB9 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Slc6a20aQ8VDB9 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Slc6a20aQ8VDB9 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Slc6a20aQ8VDB9 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Slc6a20aQ8VDB9 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Slc6a20aQ8VDB9 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Slc6a20aQ8VDB9 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Slc6a20aQ8VDB9 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Slc6a20aQ8VDB9 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Slc6a20aQ8VDB9 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Slc6a20aQ8VDB9 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Slc6a20aQ8VDB9 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Slc6a20aQ8VDB9 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Slc6a20aQ8VDB9 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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Slc6a20aQ8VDB9 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Slc6a20aQ8VDB9 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Slc6a20aQ8VDB9 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
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Slc6a20aQ8VDB9 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Slc6a20aQ8VDB9 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Slc6a20aQ8VDB9 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Slc6a20aQ8VDB9 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Slc6a20aQ8VDB9 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Slc6a20aQ8VDB9 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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Slc6a20aQ8VDB9 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Slc6a20aQ8VDB9 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Slc6a20aQ8VDB9 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Slc6a20aQ8VDB9 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Slc6a20aQ8VDB9 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Slc6a20aQ8VDB9 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Slc6a20aQ8VDB9 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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Slc6a20aQ8VDB9 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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Slc6a20aQ8VDB9 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
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Slc6a20aQ8VDB9 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Slc6a20aQ8VDB9 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Slc6a20aQ8VDB9 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Slc6a20aQ8VDB9 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Slc6a20aQ8VDB9 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Slc6a20aQ8VDB9 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC13.27□□□□□ -0.28
Slc6a20aQ8VDB9 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Slc6a20aQ8VDB9 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Slc6a20aQ8VDB9 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Slc6a20aQ8VDB9 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Slc6a20aQ8VDB9 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Slc6a20aQ8VDB9 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Slc6a20aQ8VDB9 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Slc6a20aQ8VDB9 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Slc6a20aQ8VDB9 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Slc6a20aQ8VDB9 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Slc6a20aQ8VDB9 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Slc6a20aQ8VDB9 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Slc6a20aQ8VDB9 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Slc6a20aQ8VDB9 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Slc6a20aQ8VDB9 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
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Slc6a20aQ8VDB9 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
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Slc6a20aQ8VDB9 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Slc6a20aQ8VDB9 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Slc6a20aQ8VDB9 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
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