Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2L8

Trappc12, Trafficking protein particle complex subunit 12, mousemouse

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc12Q8K2L8 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trappc12Q8K2L8 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trappc12Q8K2L8 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trappc12Q8K2L8 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trappc12Q8K2L8 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trappc12Q8K2L8 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trappc12Q8K2L8 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Trappc12Q8K2L8 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trappc12Q8K2L8 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Trappc12Q8K2L8 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Trappc12Q8K2L8 Mir6979-201ENSMUST00000183927 56 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Trappc12Q8K2L8 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trappc12Q8K2L8 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Trappc12Q8K2L8 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trappc12Q8K2L8 Fabp4-201ENSMUST00000029041 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trappc12Q8K2L8 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trappc12Q8K2L8 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trappc12Q8K2L8 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trappc12Q8K2L8 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trappc12Q8K2L8 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trappc12Q8K2L8 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trappc12Q8K2L8 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trappc12Q8K2L8 Wac-216ENSMUST00000171486 1608 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trappc12Q8K2L8 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trappc12Q8K2L8 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trappc12Q8K2L8 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trappc12Q8K2L8 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trappc12Q8K2L8 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trappc12Q8K2L8 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trappc12Q8K2L8 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trappc12Q8K2L8 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trappc12Q8K2L8 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trappc12Q8K2L8 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trappc12Q8K2L8 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trappc12Q8K2L8 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trappc12Q8K2L8 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trappc12Q8K2L8 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trappc12Q8K2L8 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trappc12Q8K2L8 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trappc12Q8K2L8 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trappc12Q8K2L8 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trappc12Q8K2L8 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trappc12Q8K2L8 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trappc12Q8K2L8 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trappc12Q8K2L8 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trappc12Q8K2L8 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Trappc12Q8K2L8 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trappc12Q8K2L8 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trappc12Q8K2L8 Gm2260-201ENSMUST00000184965 657 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Trappc12Q8K2L8 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trappc12Q8K2L8 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trappc12Q8K2L8 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trappc12Q8K2L8 AC124171.1-201ENSMUST00000221151 567 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trappc12Q8K2L8 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trappc12Q8K2L8 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trappc12Q8K2L8 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trappc12Q8K2L8 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trappc12Q8K2L8 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trappc12Q8K2L8 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trappc12Q8K2L8 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trappc12Q8K2L8 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trappc12Q8K2L8 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trappc12Q8K2L8 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trappc12Q8K2L8 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trappc12Q8K2L8 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trappc12Q8K2L8 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trappc12Q8K2L8 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trappc12Q8K2L8 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trappc12Q8K2L8 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trappc12Q8K2L8 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Trappc12Q8K2L8 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trappc12Q8K2L8 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trappc12Q8K2L8 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trappc12Q8K2L8 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trappc12Q8K2L8 B9d1os-201ENSMUST00000137010 674 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Trappc12Q8K2L8 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trappc12Q8K2L8 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trappc12Q8K2L8 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trappc12Q8K2L8 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trappc12Q8K2L8 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trappc12Q8K2L8 Gm44992-206ENSMUST00000209313 1261 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trappc12Q8K2L8 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Trappc12Q8K2L8 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trappc12Q8K2L8 Psma7-201ENSMUST00000029082 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trappc12Q8K2L8 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trappc12Q8K2L8 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trappc12Q8K2L8 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trappc12Q8K2L8 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trappc12Q8K2L8 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trappc12Q8K2L8 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trappc12Q8K2L8 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trappc12Q8K2L8 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trappc12Q8K2L8 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trappc12Q8K2L8 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trappc12Q8K2L8 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trappc12Q8K2L8 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trappc12Q8K2L8 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trappc12Q8K2L8 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trappc12Q8K2L8 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trappc12Q8K2L8 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms