Protein–RNA interactions for Protein: Q8K284

Gtf3c1, General transcription factor 3C polypeptide 1, mousemouse

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Length 2,101 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c1Q8K284 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gtf3c1Q8K284 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gtf3c1Q8K284 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gtf3c1Q8K284 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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Gtf3c1Q8K284 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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Gtf3c1Q8K284 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gtf3c1Q8K284 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
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Gtf3c1Q8K284 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gtf3c1Q8K284 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gtf3c1Q8K284 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gtf3c1Q8K284 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gtf3c1Q8K284 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gtf3c1Q8K284 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gtf3c1Q8K284 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gtf3c1Q8K284 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gtf3c1Q8K284 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gtf3c1Q8K284 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gtf3c1Q8K284 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gtf3c1Q8K284 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Gtf3c1Q8K284 Sun1-203ENSMUST00000100517 1522 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gtf3c1Q8K284 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gtf3c1Q8K284 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gtf3c1Q8K284 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gtf3c1Q8K284 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
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Gtf3c1Q8K284 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gtf3c1Q8K284 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gtf3c1Q8K284 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gtf3c1Q8K284 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
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Gtf3c1Q8K284 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gtf3c1Q8K284 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gtf3c1Q8K284 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gtf3c1Q8K284 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gtf3c1Q8K284 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
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Gtf3c1Q8K284 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gtf3c1Q8K284 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gtf3c1Q8K284 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gtf3c1Q8K284 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gtf3c1Q8K284 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gtf3c1Q8K284 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
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Gtf3c1Q8K284 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
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Gtf3c1Q8K284 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
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Gtf3c1Q8K284 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gtf3c1Q8K284 4930522L14Rik-201ENSMUST00000100937 599 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gtf3c1Q8K284 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
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Gtf3c1Q8K284 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
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Gtf3c1Q8K284 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Gtf3c1Q8K284 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Gtf3c1Q8K284 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC12.83□□□□□ -0.35
Gtf3c1Q8K284 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Gtf3c1Q8K284 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Gtf3c1Q8K284 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Gtf3c1Q8K284 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC12.83□□□□□ -0.35
Gtf3c1Q8K284 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Gtf3c1Q8K284 Mir6979-201ENSMUST00000183927 56 ntBASIC12.83□□□□□ -0.35
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Gtf3c1Q8K284 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Gtf3c1Q8K284 Net1-206ENSMUST00000222504 447 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.35
Gtf3c1Q8K284 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gtf3c1Q8K284 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gtf3c1Q8K284 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gtf3c1Q8K284 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gtf3c1Q8K284 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gtf3c1Q8K284 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gtf3c1Q8K284 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gtf3c1Q8K284 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gtf3c1Q8K284 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gtf3c1Q8K284 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gtf3c1Q8K284 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gtf3c1Q8K284 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gtf3c1Q8K284 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gtf3c1Q8K284 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gtf3c1Q8K284 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gtf3c1Q8K284 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gtf3c1Q8K284 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
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