Protein–RNA interactions for Protein: Q8CJ78

Znf628, Zinc finger protein 628, mousemouse

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Length 1,038 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf628Q8CJ78 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
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Znf628Q8CJ78 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Znf628Q8CJ78 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Znf628Q8CJ78 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Znf628Q8CJ78 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Znf628Q8CJ78 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Znf628Q8CJ78 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Znf628Q8CJ78 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Znf628Q8CJ78 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Znf628Q8CJ78 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Znf628Q8CJ78 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Znf628Q8CJ78 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Znf628Q8CJ78 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Znf628Q8CJ78 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
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Znf628Q8CJ78 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
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Znf628Q8CJ78 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Znf628Q8CJ78 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Znf628Q8CJ78 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Znf628Q8CJ78 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Znf628Q8CJ78 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Znf628Q8CJ78 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Znf628Q8CJ78 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
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Znf628Q8CJ78 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Znf628Q8CJ78 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Znf628Q8CJ78 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Znf628Q8CJ78 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Znf628Q8CJ78 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Znf628Q8CJ78 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Znf628Q8CJ78 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Znf628Q8CJ78 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Znf628Q8CJ78 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Znf628Q8CJ78 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Znf628Q8CJ78 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Znf628Q8CJ78 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Znf628Q8CJ78 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
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Znf628Q8CJ78 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Znf628Q8CJ78 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Znf628Q8CJ78 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Znf628Q8CJ78 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Znf628Q8CJ78 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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Znf628Q8CJ78 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Znf628Q8CJ78 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Znf628Q8CJ78 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
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Znf628Q8CJ78 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Znf628Q8CJ78 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Znf628Q8CJ78 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Znf628Q8CJ78 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Znf628Q8CJ78 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Znf628Q8CJ78 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Znf628Q8CJ78 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Znf628Q8CJ78 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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Znf628Q8CJ78 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Znf628Q8CJ78 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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Znf628Q8CJ78 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Znf628Q8CJ78 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Znf628Q8CJ78 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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Znf628Q8CJ78 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Znf628Q8CJ78 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Znf628Q8CJ78 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Znf628Q8CJ78 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Znf628Q8CJ78 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Znf628Q8CJ78 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Znf628Q8CJ78 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Znf628Q8CJ78 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Znf628Q8CJ78 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Znf628Q8CJ78 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Znf628Q8CJ78 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Znf628Q8CJ78 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Znf628Q8CJ78 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Znf628Q8CJ78 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Znf628Q8CJ78 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Znf628Q8CJ78 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Znf628Q8CJ78 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Znf628Q8CJ78 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Znf628Q8CJ78 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Znf628Q8CJ78 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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