Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFD4

Snx8, Sorting nexin-8, mousemouse

Predictions only

Length 459 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx8Q8CFD4 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Snx8Q8CFD4 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Snx8Q8CFD4 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Snx8Q8CFD4 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Snx8Q8CFD4 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Snx8Q8CFD4 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Snx8Q8CFD4 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Snx8Q8CFD4 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Snx8Q8CFD4 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Snx8Q8CFD4 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Snx8Q8CFD4 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Snx8Q8CFD4 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Snx8Q8CFD4 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Snx8Q8CFD4 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Snx8Q8CFD4 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Snx8Q8CFD4 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Snx8Q8CFD4 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Snx8Q8CFD4 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Snx8Q8CFD4 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Snx8Q8CFD4 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Snx8Q8CFD4 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Snx8Q8CFD4 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Snx8Q8CFD4 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Snx8Q8CFD4 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Snx8Q8CFD4 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Snx8Q8CFD4 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Snx8Q8CFD4 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Snx8Q8CFD4 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Snx8Q8CFD4 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Snx8Q8CFD4 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Snx8Q8CFD4 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Snx8Q8CFD4 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Snx8Q8CFD4 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Snx8Q8CFD4 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Snx8Q8CFD4 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Snx8Q8CFD4 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Snx8Q8CFD4 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Snx8Q8CFD4 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Snx8Q8CFD4 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Snx8Q8CFD4 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Snx8Q8CFD4 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Snx8Q8CFD4 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Snx8Q8CFD4 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Snx8Q8CFD4 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Snx8Q8CFD4 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Snx8Q8CFD4 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Snx8Q8CFD4 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Snx8Q8CFD4 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Snx8Q8CFD4 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Snx8Q8CFD4 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Snx8Q8CFD4 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Snx8Q8CFD4 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Snx8Q8CFD4 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Snx8Q8CFD4 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Snx8Q8CFD4 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Snx8Q8CFD4 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Snx8Q8CFD4 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Snx8Q8CFD4 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Snx8Q8CFD4 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Snx8Q8CFD4 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Snx8Q8CFD4 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Snx8Q8CFD4 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Snx8Q8CFD4 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Snx8Q8CFD4 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Snx8Q8CFD4 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Snx8Q8CFD4 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Snx8Q8CFD4 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Snx8Q8CFD4 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Snx8Q8CFD4 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Snx8Q8CFD4 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Snx8Q8CFD4 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Snx8Q8CFD4 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Snx8Q8CFD4 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Snx8Q8CFD4 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Snx8Q8CFD4 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Snx8Q8CFD4 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Snx8Q8CFD4 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Snx8Q8CFD4 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Snx8Q8CFD4 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Snx8Q8CFD4 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Snx8Q8CFD4 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Snx8Q8CFD4 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Snx8Q8CFD4 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Snx8Q8CFD4 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Snx8Q8CFD4 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Snx8Q8CFD4 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Snx8Q8CFD4 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Snx8Q8CFD4 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Snx8Q8CFD4 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Snx8Q8CFD4 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Snx8Q8CFD4 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Snx8Q8CFD4 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Snx8Q8CFD4 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Snx8Q8CFD4 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Snx8Q8CFD4 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Snx8Q8CFD4 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Snx8Q8CFD4 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Snx8Q8CFD4 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Snx8Q8CFD4 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Snx8Q8CFD4 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
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