Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEC0

Nup88, Nuclear pore complex protein Nup88, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 753 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup88Q8CEC0 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nup88Q8CEC0 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nup88Q8CEC0 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nup88Q8CEC0 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nup88Q8CEC0 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nup88Q8CEC0 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nup88Q8CEC0 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nup88Q8CEC0 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nup88Q8CEC0 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nup88Q8CEC0 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nup88Q8CEC0 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Nup88Q8CEC0 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nup88Q8CEC0 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nup88Q8CEC0 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nup88Q8CEC0 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nup88Q8CEC0 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Nup88Q8CEC0 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nup88Q8CEC0 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nup88Q8CEC0 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nup88Q8CEC0 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nup88Q8CEC0 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nup88Q8CEC0 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nup88Q8CEC0 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nup88Q8CEC0 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Nup88Q8CEC0 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nup88Q8CEC0 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nup88Q8CEC0 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nup88Q8CEC0 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nup88Q8CEC0 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nup88Q8CEC0 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nup88Q8CEC0 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nup88Q8CEC0 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nup88Q8CEC0 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nup88Q8CEC0 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Nup88Q8CEC0 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nup88Q8CEC0 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nup88Q8CEC0 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nup88Q8CEC0 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nup88Q8CEC0 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nup88Q8CEC0 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nup88Q8CEC0 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nup88Q8CEC0 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nup88Q8CEC0 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nup88Q8CEC0 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nup88Q8CEC0 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nup88Q8CEC0 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nup88Q8CEC0 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nup88Q8CEC0 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nup88Q8CEC0 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nup88Q8CEC0 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Nup88Q8CEC0 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nup88Q8CEC0 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nup88Q8CEC0 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nup88Q8CEC0 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nup88Q8CEC0 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Nup88Q8CEC0 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Nup88Q8CEC0 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nup88Q8CEC0 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nup88Q8CEC0 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nup88Q8CEC0 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nup88Q8CEC0 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nup88Q8CEC0 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nup88Q8CEC0 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nup88Q8CEC0 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nup88Q8CEC0 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nup88Q8CEC0 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Nup88Q8CEC0 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nup88Q8CEC0 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Nup88Q8CEC0 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Nup88Q8CEC0 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nup88Q8CEC0 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nup88Q8CEC0 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nup88Q8CEC0 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nup88Q8CEC0 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nup88Q8CEC0 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nup88Q8CEC0 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nup88Q8CEC0 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nup88Q8CEC0 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nup88Q8CEC0 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Nup88Q8CEC0 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nup88Q8CEC0 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Nup88Q8CEC0 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nup88Q8CEC0 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nup88Q8CEC0 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nup88Q8CEC0 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nup88Q8CEC0 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nup88Q8CEC0 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nup88Q8CEC0 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nup88Q8CEC0 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nup88Q8CEC0 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nup88Q8CEC0 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nup88Q8CEC0 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nup88Q8CEC0 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nup88Q8CEC0 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nup88Q8CEC0 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nup88Q8CEC0 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nup88Q8CEC0 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nup88Q8CEC0 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Nup88Q8CEC0 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nup88Q8CEC0 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.6 ms