Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDG5

Crebrf, CREB3 regulatory factor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrebrfQ8CDG5 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CrebrfQ8CDG5 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CrebrfQ8CDG5 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CrebrfQ8CDG5 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CrebrfQ8CDG5 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CrebrfQ8CDG5 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CrebrfQ8CDG5 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CrebrfQ8CDG5 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CrebrfQ8CDG5 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CrebrfQ8CDG5 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CrebrfQ8CDG5 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CrebrfQ8CDG5 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CrebrfQ8CDG5 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CrebrfQ8CDG5 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CrebrfQ8CDG5 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CrebrfQ8CDG5 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CrebrfQ8CDG5 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CrebrfQ8CDG5 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CrebrfQ8CDG5 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CrebrfQ8CDG5 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CrebrfQ8CDG5 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CrebrfQ8CDG5 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CrebrfQ8CDG5 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CrebrfQ8CDG5 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CrebrfQ8CDG5 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CrebrfQ8CDG5 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CrebrfQ8CDG5 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CrebrfQ8CDG5 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CrebrfQ8CDG5 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CrebrfQ8CDG5 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CrebrfQ8CDG5 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CrebrfQ8CDG5 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CrebrfQ8CDG5 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CrebrfQ8CDG5 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CrebrfQ8CDG5 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CrebrfQ8CDG5 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CrebrfQ8CDG5 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CrebrfQ8CDG5 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CrebrfQ8CDG5 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CrebrfQ8CDG5 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CrebrfQ8CDG5 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CrebrfQ8CDG5 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CrebrfQ8CDG5 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CrebrfQ8CDG5 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CrebrfQ8CDG5 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CrebrfQ8CDG5 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CrebrfQ8CDG5 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CrebrfQ8CDG5 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CrebrfQ8CDG5 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CrebrfQ8CDG5 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CrebrfQ8CDG5 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CrebrfQ8CDG5 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CrebrfQ8CDG5 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CrebrfQ8CDG5 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CrebrfQ8CDG5 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CrebrfQ8CDG5 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CrebrfQ8CDG5 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CrebrfQ8CDG5 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CrebrfQ8CDG5 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CrebrfQ8CDG5 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CrebrfQ8CDG5 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CrebrfQ8CDG5 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CrebrfQ8CDG5 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CrebrfQ8CDG5 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CrebrfQ8CDG5 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CrebrfQ8CDG5 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CrebrfQ8CDG5 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CrebrfQ8CDG5 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CrebrfQ8CDG5 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CrebrfQ8CDG5 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CrebrfQ8CDG5 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CrebrfQ8CDG5 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CrebrfQ8CDG5 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CrebrfQ8CDG5 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CrebrfQ8CDG5 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CrebrfQ8CDG5 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CrebrfQ8CDG5 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CrebrfQ8CDG5 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CrebrfQ8CDG5 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CrebrfQ8CDG5 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CrebrfQ8CDG5 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CrebrfQ8CDG5 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CrebrfQ8CDG5 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CrebrfQ8CDG5 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CrebrfQ8CDG5 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CrebrfQ8CDG5 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CrebrfQ8CDG5 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CrebrfQ8CDG5 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CrebrfQ8CDG5 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CrebrfQ8CDG5 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CrebrfQ8CDG5 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CrebrfQ8CDG5 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CrebrfQ8CDG5 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CrebrfQ8CDG5 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CrebrfQ8CDG5 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CrebrfQ8CDG5 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CrebrfQ8CDG5 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CrebrfQ8CDG5 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CrebrfQ8CDG5 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CrebrfQ8CDG5 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms