Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5L3

Cnot2, CCR4-NOT transcription complex subunit 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 540 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot2Q8C5L3 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cnot2Q8C5L3 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cnot2Q8C5L3 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cnot2Q8C5L3 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cnot2Q8C5L3 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cnot2Q8C5L3 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cnot2Q8C5L3 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cnot2Q8C5L3 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cnot2Q8C5L3 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cnot2Q8C5L3 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cnot2Q8C5L3 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cnot2Q8C5L3 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cnot2Q8C5L3 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cnot2Q8C5L3 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cnot2Q8C5L3 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cnot2Q8C5L3 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cnot2Q8C5L3 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cnot2Q8C5L3 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cnot2Q8C5L3 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cnot2Q8C5L3 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cnot2Q8C5L3 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cnot2Q8C5L3 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cnot2Q8C5L3 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cnot2Q8C5L3 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cnot2Q8C5L3 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cnot2Q8C5L3 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Cnot2Q8C5L3 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cnot2Q8C5L3 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cnot2Q8C5L3 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cnot2Q8C5L3 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cnot2Q8C5L3 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cnot2Q8C5L3 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cnot2Q8C5L3 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cnot2Q8C5L3 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cnot2Q8C5L3 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cnot2Q8C5L3 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cnot2Q8C5L3 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cnot2Q8C5L3 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Cnot2Q8C5L3 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cnot2Q8C5L3 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cnot2Q8C5L3 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cnot2Q8C5L3 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cnot2Q8C5L3 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cnot2Q8C5L3 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cnot2Q8C5L3 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cnot2Q8C5L3 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Cnot2Q8C5L3 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cnot2Q8C5L3 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cnot2Q8C5L3 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cnot2Q8C5L3 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cnot2Q8C5L3 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cnot2Q8C5L3 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cnot2Q8C5L3 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cnot2Q8C5L3 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cnot2Q8C5L3 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cnot2Q8C5L3 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cnot2Q8C5L3 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cnot2Q8C5L3 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cnot2Q8C5L3 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cnot2Q8C5L3 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cnot2Q8C5L3 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cnot2Q8C5L3 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cnot2Q8C5L3 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cnot2Q8C5L3 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cnot2Q8C5L3 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Cnot2Q8C5L3 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cnot2Q8C5L3 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cnot2Q8C5L3 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Cnot2Q8C5L3 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cnot2Q8C5L3 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Cnot2Q8C5L3 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cnot2Q8C5L3 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cnot2Q8C5L3 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cnot2Q8C5L3 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cnot2Q8C5L3 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cnot2Q8C5L3 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cnot2Q8C5L3 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cnot2Q8C5L3 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cnot2Q8C5L3 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cnot2Q8C5L3 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cnot2Q8C5L3 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cnot2Q8C5L3 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cnot2Q8C5L3 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cnot2Q8C5L3 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cnot2Q8C5L3 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cnot2Q8C5L3 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cnot2Q8C5L3 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cnot2Q8C5L3 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Cnot2Q8C5L3 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cnot2Q8C5L3 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Cnot2Q8C5L3 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cnot2Q8C5L3 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Cnot2Q8C5L3 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cnot2Q8C5L3 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cnot2Q8C5L3 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cnot2Q8C5L3 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cnot2Q8C5L3 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cnot2Q8C5L3 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cnot2Q8C5L3 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cnot2Q8C5L3 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
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