Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0J2

Atg16l1, Autophagy-related protein 16-1, mousemouse

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Length 607 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg16l1Q8C0J2 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Atg16l1Q8C0J2 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Atg16l1Q8C0J2 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Atg16l1Q8C0J2 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Atg16l1Q8C0J2 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Atg16l1Q8C0J2 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Atg16l1Q8C0J2 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Atg16l1Q8C0J2 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Atg16l1Q8C0J2 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Atg16l1Q8C0J2 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Atg16l1Q8C0J2 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Atg16l1Q8C0J2 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Atg16l1Q8C0J2 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Atg16l1Q8C0J2 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Atg16l1Q8C0J2 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Atg16l1Q8C0J2 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Atg16l1Q8C0J2 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Atg16l1Q8C0J2 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Atg16l1Q8C0J2 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Atg16l1Q8C0J2 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Atg16l1Q8C0J2 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Atg16l1Q8C0J2 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Atg16l1Q8C0J2 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Atg16l1Q8C0J2 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Atg16l1Q8C0J2 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Atg16l1Q8C0J2 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Atg16l1Q8C0J2 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Atg16l1Q8C0J2 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Atg16l1Q8C0J2 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Atg16l1Q8C0J2 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Atg16l1Q8C0J2 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Atg16l1Q8C0J2 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Atg16l1Q8C0J2 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Atg16l1Q8C0J2 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Atg16l1Q8C0J2 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Atg16l1Q8C0J2 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Atg16l1Q8C0J2 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Atg16l1Q8C0J2 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Atg16l1Q8C0J2 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Atg16l1Q8C0J2 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Atg16l1Q8C0J2 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Atg16l1Q8C0J2 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Atg16l1Q8C0J2 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Atg16l1Q8C0J2 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Atg16l1Q8C0J2 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Atg16l1Q8C0J2 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Atg16l1Q8C0J2 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Atg16l1Q8C0J2 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Atg16l1Q8C0J2 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Atg16l1Q8C0J2 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Atg16l1Q8C0J2 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Atg16l1Q8C0J2 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Atg16l1Q8C0J2 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Atg16l1Q8C0J2 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Atg16l1Q8C0J2 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Atg16l1Q8C0J2 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Atg16l1Q8C0J2 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Atg16l1Q8C0J2 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Atg16l1Q8C0J2 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Atg16l1Q8C0J2 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
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Atg16l1Q8C0J2 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Atg16l1Q8C0J2 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Atg16l1Q8C0J2 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Atg16l1Q8C0J2 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Atg16l1Q8C0J2 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Atg16l1Q8C0J2 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Atg16l1Q8C0J2 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
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Atg16l1Q8C0J2 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Atg16l1Q8C0J2 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Atg16l1Q8C0J2 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Atg16l1Q8C0J2 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Atg16l1Q8C0J2 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Atg16l1Q8C0J2 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Atg16l1Q8C0J2 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Atg16l1Q8C0J2 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Atg16l1Q8C0J2 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Atg16l1Q8C0J2 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Atg16l1Q8C0J2 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Atg16l1Q8C0J2 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Atg16l1Q8C0J2 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Atg16l1Q8C0J2 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Atg16l1Q8C0J2 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Atg16l1Q8C0J2 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Atg16l1Q8C0J2 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Atg16l1Q8C0J2 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Atg16l1Q8C0J2 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Atg16l1Q8C0J2 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Atg16l1Q8C0J2 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Atg16l1Q8C0J2 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Atg16l1Q8C0J2 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Atg16l1Q8C0J2 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Atg16l1Q8C0J2 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Atg16l1Q8C0J2 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Atg16l1Q8C0J2 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Atg16l1Q8C0J2 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Atg16l1Q8C0J2 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Atg16l1Q8C0J2 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
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