Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX13

Ube3d, E3 ubiquitin-protein ligase E3D, mousemouse

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube3dQ8BX13 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Ube3dQ8BX13 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Ube3dQ8BX13 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Ube3dQ8BX13 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Ube3dQ8BX13 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ube3dQ8BX13 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ube3dQ8BX13 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ube3dQ8BX13 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ube3dQ8BX13 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ube3dQ8BX13 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Ube3dQ8BX13 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Ube3dQ8BX13 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
Ube3dQ8BX13 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ube3dQ8BX13 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ube3dQ8BX13 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ube3dQ8BX13 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ube3dQ8BX13 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Ube3dQ8BX13 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ube3dQ8BX13 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ube3dQ8BX13 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ube3dQ8BX13 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ube3dQ8BX13 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ube3dQ8BX13 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ube3dQ8BX13 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ube3dQ8BX13 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ube3dQ8BX13 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Ube3dQ8BX13 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ube3dQ8BX13 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Ube3dQ8BX13 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Ube3dQ8BX13 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Ube3dQ8BX13 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Ube3dQ8BX13 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ube3dQ8BX13 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Ube3dQ8BX13 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Ube3dQ8BX13 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ube3dQ8BX13 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ube3dQ8BX13 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ube3dQ8BX13 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ube3dQ8BX13 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ube3dQ8BX13 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ube3dQ8BX13 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ube3dQ8BX13 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Ube3dQ8BX13 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ube3dQ8BX13 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ube3dQ8BX13 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ube3dQ8BX13 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ube3dQ8BX13 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ube3dQ8BX13 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ube3dQ8BX13 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ube3dQ8BX13 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ube3dQ8BX13 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ube3dQ8BX13 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ube3dQ8BX13 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ube3dQ8BX13 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ube3dQ8BX13 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
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Ube3dQ8BX13 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ube3dQ8BX13 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ube3dQ8BX13 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ube3dQ8BX13 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ube3dQ8BX13 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ube3dQ8BX13 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ube3dQ8BX13 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
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Ube3dQ8BX13 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ube3dQ8BX13 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ube3dQ8BX13 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Ube3dQ8BX13 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ube3dQ8BX13 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ube3dQ8BX13 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ube3dQ8BX13 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ube3dQ8BX13 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ube3dQ8BX13 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ube3dQ8BX13 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ube3dQ8BX13 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ube3dQ8BX13 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ube3dQ8BX13 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ube3dQ8BX13 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ube3dQ8BX13 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ube3dQ8BX13 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ube3dQ8BX13 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ube3dQ8BX13 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ube3dQ8BX13 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ube3dQ8BX13 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ube3dQ8BX13 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ube3dQ8BX13 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ube3dQ8BX13 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ube3dQ8BX13 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ube3dQ8BX13 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ube3dQ8BX13 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ube3dQ8BX13 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
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