Protein–RNA interactions for Protein: Q80XU8

Lrfn4, Leucine-rich repeat and fibronectin type-III domain-containing protein 4, mousemouse

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Length 636 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrfn4Q80XU8 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Lrfn4Q80XU8 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Lrfn4Q80XU8 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Lrfn4Q80XU8 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Lrfn4Q80XU8 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Lrfn4Q80XU8 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Lrfn4Q80XU8 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Lrfn4Q80XU8 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Lrfn4Q80XU8 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Lrfn4Q80XU8 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Lrfn4Q80XU8 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Lrfn4Q80XU8 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Lrfn4Q80XU8 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Lrfn4Q80XU8 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Lrfn4Q80XU8 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Lrfn4Q80XU8 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Lrfn4Q80XU8 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Lrfn4Q80XU8 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Lrfn4Q80XU8 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Lrfn4Q80XU8 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Lrfn4Q80XU8 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Lrfn4Q80XU8 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Lrfn4Q80XU8 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Lrfn4Q80XU8 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Lrfn4Q80XU8 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Lrfn4Q80XU8 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Lrfn4Q80XU8 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Lrfn4Q80XU8 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Lrfn4Q80XU8 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Lrfn4Q80XU8 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Lrfn4Q80XU8 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Lrfn4Q80XU8 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Lrfn4Q80XU8 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Lrfn4Q80XU8 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Lrfn4Q80XU8 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Lrfn4Q80XU8 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Lrfn4Q80XU8 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Lrfn4Q80XU8 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Lrfn4Q80XU8 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Lrfn4Q80XU8 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Lrfn4Q80XU8 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Lrfn4Q80XU8 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Lrfn4Q80XU8 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Lrfn4Q80XU8 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Lrfn4Q80XU8 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC11.96□□□□□ -0.5
Lrfn4Q80XU8 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Lrfn4Q80XU8 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Lrfn4Q80XU8 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Lrfn4Q80XU8 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Lrfn4Q80XU8 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Lrfn4Q80XU8 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Lrfn4Q80XU8 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
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Lrfn4Q80XU8 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Lrfn4Q80XU8 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Lrfn4Q80XU8 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Lrfn4Q80XU8 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Lrfn4Q80XU8 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Lrfn4Q80XU8 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Lrfn4Q80XU8 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
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Lrfn4Q80XU8 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
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Lrfn4Q80XU8 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
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Lrfn4Q80XU8 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Lrfn4Q80XU8 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Lrfn4Q80XU8 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Lrfn4Q80XU8 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Lrfn4Q80XU8 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Lrfn4Q80XU8 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
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Lrfn4Q80XU8 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Lrfn4Q80XU8 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Lrfn4Q80XU8 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Lrfn4Q80XU8 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Lrfn4Q80XU8 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Lrfn4Q80XU8 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Lrfn4Q80XU8 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Lrfn4Q80XU8 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Lrfn4Q80XU8 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Lrfn4Q80XU8 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Lrfn4Q80XU8 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Lrfn4Q80XU8 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Lrfn4Q80XU8 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Lrfn4Q80XU8 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Lrfn4Q80XU8 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Lrfn4Q80XU8 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Lrfn4Q80XU8 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Lrfn4Q80XU8 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Lrfn4Q80XU8 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Lrfn4Q80XU8 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Lrfn4Q80XU8 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
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