Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF1

Dsg1b, Desmoglein-1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,060 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1bQ7TSF1 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Dsg1bQ7TSF1 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Dsg1bQ7TSF1 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Dsg1bQ7TSF1 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Dsg1bQ7TSF1 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Dsg1bQ7TSF1 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Dsg1bQ7TSF1 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Dsg1bQ7TSF1 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Dsg1bQ7TSF1 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Dsg1bQ7TSF1 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Dsg1bQ7TSF1 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Dsg1bQ7TSF1 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Dsg1bQ7TSF1 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Dsg1bQ7TSF1 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Dsg1bQ7TSF1 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Dsg1bQ7TSF1 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Dsg1bQ7TSF1 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Dsg1bQ7TSF1 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Dsg1bQ7TSF1 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Dsg1bQ7TSF1 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Dsg1bQ7TSF1 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Dsg1bQ7TSF1 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Dsg1bQ7TSF1 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Dsg1bQ7TSF1 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Dsg1bQ7TSF1 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Dsg1bQ7TSF1 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Dsg1bQ7TSF1 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Dsg1bQ7TSF1 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Dsg1bQ7TSF1 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Dsg1bQ7TSF1 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Dsg1bQ7TSF1 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Dsg1bQ7TSF1 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Dsg1bQ7TSF1 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Dsg1bQ7TSF1 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Dsg1bQ7TSF1 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Dsg1bQ7TSF1 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Dsg1bQ7TSF1 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Dsg1bQ7TSF1 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Dsg1bQ7TSF1 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Dsg1bQ7TSF1 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Dsg1bQ7TSF1 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Dsg1bQ7TSF1 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Dsg1bQ7TSF1 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Dsg1bQ7TSF1 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Dsg1bQ7TSF1 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Dsg1bQ7TSF1 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Dsg1bQ7TSF1 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Dsg1bQ7TSF1 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Dsg1bQ7TSF1 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Dsg1bQ7TSF1 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Dsg1bQ7TSF1 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Dsg1bQ7TSF1 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Dsg1bQ7TSF1 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Dsg1bQ7TSF1 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Dsg1bQ7TSF1 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Dsg1bQ7TSF1 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Dsg1bQ7TSF1 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Dsg1bQ7TSF1 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Dsg1bQ7TSF1 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Dsg1bQ7TSF1 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Dsg1bQ7TSF1 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Dsg1bQ7TSF1 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Dsg1bQ7TSF1 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Dsg1bQ7TSF1 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Dsg1bQ7TSF1 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Dsg1bQ7TSF1 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Dsg1bQ7TSF1 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Dsg1bQ7TSF1 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Dsg1bQ7TSF1 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Dsg1bQ7TSF1 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Dsg1bQ7TSF1 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Dsg1bQ7TSF1 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Dsg1bQ7TSF1 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Dsg1bQ7TSF1 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Dsg1bQ7TSF1 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Dsg1bQ7TSF1 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Dsg1bQ7TSF1 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Dsg1bQ7TSF1 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Dsg1bQ7TSF1 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Dsg1bQ7TSF1 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Dsg1bQ7TSF1 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Dsg1bQ7TSF1 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Dsg1bQ7TSF1 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Dsg1bQ7TSF1 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Dsg1bQ7TSF1 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Dsg1bQ7TSF1 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Dsg1bQ7TSF1 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Dsg1bQ7TSF1 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Dsg1bQ7TSF1 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Dsg1bQ7TSF1 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Dsg1bQ7TSF1 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Dsg1bQ7TSF1 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Dsg1bQ7TSF1 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Dsg1bQ7TSF1 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Dsg1bQ7TSF1 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Dsg1bQ7TSF1 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Dsg1bQ7TSF1 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Dsg1bQ7TSF1 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Dsg1bQ7TSF1 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Dsg1bQ7TSF1 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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