Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF0

Dsg1c, Desmoglein-1-gamma, mousemouse

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1cQ7TSF0 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Dsg1cQ7TSF0 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Dsg1cQ7TSF0 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Dsg1cQ7TSF0 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Dsg1cQ7TSF0 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Dsg1cQ7TSF0 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Dsg1cQ7TSF0 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Dsg1cQ7TSF0 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Dsg1cQ7TSF0 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Dsg1cQ7TSF0 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Dsg1cQ7TSF0 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Dsg1cQ7TSF0 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Dsg1cQ7TSF0 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Dsg1cQ7TSF0 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Dsg1cQ7TSF0 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Dsg1cQ7TSF0 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Dsg1cQ7TSF0 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Dsg1cQ7TSF0 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Dsg1cQ7TSF0 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Dsg1cQ7TSF0 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Dsg1cQ7TSF0 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Dsg1cQ7TSF0 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Dsg1cQ7TSF0 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Dsg1cQ7TSF0 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Dsg1cQ7TSF0 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Dsg1cQ7TSF0 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Dsg1cQ7TSF0 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Dsg1cQ7TSF0 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Dsg1cQ7TSF0 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Dsg1cQ7TSF0 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Dsg1cQ7TSF0 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Dsg1cQ7TSF0 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Dsg1cQ7TSF0 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Dsg1cQ7TSF0 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Dsg1cQ7TSF0 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Dsg1cQ7TSF0 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Dsg1cQ7TSF0 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Dsg1cQ7TSF0 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Dsg1cQ7TSF0 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Dsg1cQ7TSF0 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Dsg1cQ7TSF0 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Dsg1cQ7TSF0 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Dsg1cQ7TSF0 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Dsg1cQ7TSF0 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Dsg1cQ7TSF0 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Dsg1cQ7TSF0 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Dsg1cQ7TSF0 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Dsg1cQ7TSF0 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Dsg1cQ7TSF0 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Dsg1cQ7TSF0 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Dsg1cQ7TSF0 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Dsg1cQ7TSF0 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Dsg1cQ7TSF0 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Dsg1cQ7TSF0 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Dsg1cQ7TSF0 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Dsg1cQ7TSF0 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Dsg1cQ7TSF0 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Dsg1cQ7TSF0 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Dsg1cQ7TSF0 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Dsg1cQ7TSF0 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Dsg1cQ7TSF0 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Dsg1cQ7TSF0 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Dsg1cQ7TSF0 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Dsg1cQ7TSF0 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Dsg1cQ7TSF0 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Dsg1cQ7TSF0 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Dsg1cQ7TSF0 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Dsg1cQ7TSF0 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Dsg1cQ7TSF0 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Dsg1cQ7TSF0 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Dsg1cQ7TSF0 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Dsg1cQ7TSF0 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Dsg1cQ7TSF0 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Dsg1cQ7TSF0 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Dsg1cQ7TSF0 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Dsg1cQ7TSF0 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Dsg1cQ7TSF0 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Dsg1cQ7TSF0 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Dsg1cQ7TSF0 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Dsg1cQ7TSF0 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Dsg1cQ7TSF0 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Dsg1cQ7TSF0 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Dsg1cQ7TSF0 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Dsg1cQ7TSF0 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Dsg1cQ7TSF0 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Dsg1cQ7TSF0 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Dsg1cQ7TSF0 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Dsg1cQ7TSF0 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Dsg1cQ7TSF0 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Dsg1cQ7TSF0 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Dsg1cQ7TSF0 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Dsg1cQ7TSF0 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Dsg1cQ7TSF0 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Dsg1cQ7TSF0 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Dsg1cQ7TSF0 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Dsg1cQ7TSF0 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Dsg1cQ7TSF0 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Dsg1cQ7TSF0 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Dsg1cQ7TSF0 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Dsg1cQ7TSF0 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.8 ms