Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPR4

Actn1, Alpha-actinin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 892 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actn1Q7TPR4 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Actn1Q7TPR4 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Actn1Q7TPR4 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Actn1Q7TPR4 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Actn1Q7TPR4 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Actn1Q7TPR4 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Actn1Q7TPR4 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Actn1Q7TPR4 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Actn1Q7TPR4 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Actn1Q7TPR4 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Actn1Q7TPR4 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Actn1Q7TPR4 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Actn1Q7TPR4 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Actn1Q7TPR4 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Actn1Q7TPR4 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Actn1Q7TPR4 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Actn1Q7TPR4 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Actn1Q7TPR4 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Actn1Q7TPR4 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Actn1Q7TPR4 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Actn1Q7TPR4 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Actn1Q7TPR4 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Actn1Q7TPR4 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Actn1Q7TPR4 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Actn1Q7TPR4 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Actn1Q7TPR4 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Actn1Q7TPR4 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Actn1Q7TPR4 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Actn1Q7TPR4 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Actn1Q7TPR4 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Actn1Q7TPR4 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Actn1Q7TPR4 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Actn1Q7TPR4 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Actn1Q7TPR4 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Actn1Q7TPR4 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Actn1Q7TPR4 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Actn1Q7TPR4 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Actn1Q7TPR4 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Actn1Q7TPR4 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Actn1Q7TPR4 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Actn1Q7TPR4 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Actn1Q7TPR4 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Actn1Q7TPR4 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Actn1Q7TPR4 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Actn1Q7TPR4 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Actn1Q7TPR4 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Actn1Q7TPR4 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Actn1Q7TPR4 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Actn1Q7TPR4 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Actn1Q7TPR4 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Actn1Q7TPR4 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Actn1Q7TPR4 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Actn1Q7TPR4 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Actn1Q7TPR4 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Actn1Q7TPR4 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Actn1Q7TPR4 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Actn1Q7TPR4 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Actn1Q7TPR4 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Actn1Q7TPR4 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Actn1Q7TPR4 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Actn1Q7TPR4 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Actn1Q7TPR4 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Actn1Q7TPR4 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Actn1Q7TPR4 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Actn1Q7TPR4 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Actn1Q7TPR4 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Actn1Q7TPR4 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Actn1Q7TPR4 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Actn1Q7TPR4 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Actn1Q7TPR4 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Actn1Q7TPR4 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Actn1Q7TPR4 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Actn1Q7TPR4 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Actn1Q7TPR4 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Actn1Q7TPR4 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Actn1Q7TPR4 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Actn1Q7TPR4 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Actn1Q7TPR4 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Actn1Q7TPR4 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Actn1Q7TPR4 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Actn1Q7TPR4 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Actn1Q7TPR4 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Actn1Q7TPR4 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Actn1Q7TPR4 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Actn1Q7TPR4 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Actn1Q7TPR4 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Actn1Q7TPR4 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Actn1Q7TPR4 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Actn1Q7TPR4 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Actn1Q7TPR4 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Actn1Q7TPR4 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Actn1Q7TPR4 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Actn1Q7TPR4 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Actn1Q7TPR4 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Actn1Q7TPR4 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Actn1Q7TPR4 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Actn1Q7TPR4 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Actn1Q7TPR4 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Actn1Q7TPR4 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Actn1Q7TPR4 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.5 ms