Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPM1

Prrc2b, Protein PRRC2B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrc2bQ7TPM1 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Prrc2bQ7TPM1 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Prrc2bQ7TPM1 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Prrc2bQ7TPM1 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Prrc2bQ7TPM1 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Prrc2bQ7TPM1 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Prrc2bQ7TPM1 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Prrc2bQ7TPM1 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Prrc2bQ7TPM1 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Prrc2bQ7TPM1 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Prrc2bQ7TPM1 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Prrc2bQ7TPM1 Gm23200-201ENSMUST00000104379 132 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Prrc2bQ7TPM1 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Prrc2bQ7TPM1 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Prrc2bQ7TPM1 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Prrc2bQ7TPM1 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Prrc2bQ7TPM1 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Prrc2bQ7TPM1 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Prrc2bQ7TPM1 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Prrc2bQ7TPM1 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Prrc2bQ7TPM1 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Prrc2bQ7TPM1 Gm19208-201ENSMUST00000213861 912 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Prrc2bQ7TPM1 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Prrc2bQ7TPM1 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Prrc2bQ7TPM1 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Prrc2bQ7TPM1 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Prrc2bQ7TPM1 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Prrc2bQ7TPM1 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Prrc2bQ7TPM1 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Prrc2bQ7TPM1 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Prrc2bQ7TPM1 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Prrc2bQ7TPM1 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Prrc2bQ7TPM1 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Prrc2bQ7TPM1 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Prrc2bQ7TPM1 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Prrc2bQ7TPM1 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Prrc2bQ7TPM1 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Prrc2bQ7TPM1 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Prrc2bQ7TPM1 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Prrc2bQ7TPM1 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Prrc2bQ7TPM1 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Prrc2bQ7TPM1 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Prrc2bQ7TPM1 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Prrc2bQ7TPM1 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Prrc2bQ7TPM1 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Prrc2bQ7TPM1 Cyb5d1-202ENSMUST00000108660 1034 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Prrc2bQ7TPM1 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Prrc2bQ7TPM1 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Prrc2bQ7TPM1 Gm14263-201ENSMUST00000117955 746 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Prrc2bQ7TPM1 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Prrc2bQ7TPM1 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Prrc2bQ7TPM1 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Prrc2bQ7TPM1 Eloc-207ENSMUST00000187910 620 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Prrc2bQ7TPM1 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Prrc2bQ7TPM1 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Prrc2bQ7TPM1 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Prrc2bQ7TPM1 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Prrc2bQ7TPM1 Tnni3-201ENSMUST00000098859 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Prrc2bQ7TPM1 Sun1-203ENSMUST00000100517 1522 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Prrc2bQ7TPM1 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Prrc2bQ7TPM1 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Prrc2bQ7TPM1 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Prrc2bQ7TPM1 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Prrc2bQ7TPM1 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Prrc2bQ7TPM1 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Prrc2bQ7TPM1 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Prrc2bQ7TPM1 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Prrc2bQ7TPM1 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Prrc2bQ7TPM1 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Prrc2bQ7TPM1 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Prrc2bQ7TPM1 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Prrc2bQ7TPM1 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Prrc2bQ7TPM1 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Prrc2bQ7TPM1 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Prrc2bQ7TPM1 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Prrc2bQ7TPM1 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Prrc2bQ7TPM1 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Prrc2bQ7TPM1 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Prrc2bQ7TPM1 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Prrc2bQ7TPM1 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Prrc2bQ7TPM1 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Prrc2bQ7TPM1 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Prrc2bQ7TPM1 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Prrc2bQ7TPM1 Gsdma2-201ENSMUST00000017355 1314 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Prrc2bQ7TPM1 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Prrc2bQ7TPM1 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Prrc2bQ7TPM1 Gm34767-201ENSMUST00000191813 1062 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Prrc2bQ7TPM1 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Prrc2bQ7TPM1 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Prrc2bQ7TPM1 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Prrc2bQ7TPM1 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Prrc2bQ7TPM1 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Prrc2bQ7TPM1 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Prrc2bQ7TPM1 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Prrc2bQ7TPM1 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Prrc2bQ7TPM1 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Prrc2bQ7TPM1 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Prrc2bQ7TPM1 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Prrc2bQ7TPM1 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Prrc2bQ7TPM1 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.4 ms