Protein–RNA interactions for Protein: Q78HU7

Gypc, Glycophorin-C, mousemouse

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Length 95 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GypcQ78HU7 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GypcQ78HU7 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GypcQ78HU7 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GypcQ78HU7 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GypcQ78HU7 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GypcQ78HU7 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GypcQ78HU7 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GypcQ78HU7 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GypcQ78HU7 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GypcQ78HU7 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GypcQ78HU7 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GypcQ78HU7 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GypcQ78HU7 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GypcQ78HU7 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GypcQ78HU7 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GypcQ78HU7 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GypcQ78HU7 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GypcQ78HU7 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GypcQ78HU7 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GypcQ78HU7 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GypcQ78HU7 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GypcQ78HU7 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GypcQ78HU7 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GypcQ78HU7 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GypcQ78HU7 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GypcQ78HU7 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GypcQ78HU7 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GypcQ78HU7 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
GypcQ78HU7 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GypcQ78HU7 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GypcQ78HU7 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GypcQ78HU7 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
GypcQ78HU7 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GypcQ78HU7 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GypcQ78HU7 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GypcQ78HU7 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GypcQ78HU7 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GypcQ78HU7 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GypcQ78HU7 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
GypcQ78HU7 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GypcQ78HU7 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GypcQ78HU7 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GypcQ78HU7 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GypcQ78HU7 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GypcQ78HU7 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GypcQ78HU7 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GypcQ78HU7 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GypcQ78HU7 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GypcQ78HU7 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GypcQ78HU7 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GypcQ78HU7 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GypcQ78HU7 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GypcQ78HU7 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GypcQ78HU7 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GypcQ78HU7 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GypcQ78HU7 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GypcQ78HU7 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GypcQ78HU7 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GypcQ78HU7 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GypcQ78HU7 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GypcQ78HU7 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GypcQ78HU7 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
GypcQ78HU7 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
GypcQ78HU7 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GypcQ78HU7 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GypcQ78HU7 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GypcQ78HU7 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
GypcQ78HU7 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GypcQ78HU7 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GypcQ78HU7 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GypcQ78HU7 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GypcQ78HU7 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GypcQ78HU7 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GypcQ78HU7 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GypcQ78HU7 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GypcQ78HU7 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GypcQ78HU7 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GypcQ78HU7 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GypcQ78HU7 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GypcQ78HU7 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GypcQ78HU7 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GypcQ78HU7 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GypcQ78HU7 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GypcQ78HU7 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GypcQ78HU7 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GypcQ78HU7 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GypcQ78HU7 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GypcQ78HU7 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
GypcQ78HU7 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
GypcQ78HU7 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GypcQ78HU7 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GypcQ78HU7 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GypcQ78HU7 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
GypcQ78HU7 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GypcQ78HU7 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GypcQ78HU7 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GypcQ78HU7 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GypcQ78HU7 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
GypcQ78HU7 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
GypcQ78HU7 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms