Protein–RNA interactions for Protein: Q6XAS3

Ssx9, MCG116991, isoform CRA_b, mousemouse

Predictions only

Length 170 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssx9Q6XAS3 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ssx9Q6XAS3 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ssx9Q6XAS3 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Ssx9Q6XAS3 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ssx9Q6XAS3 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Ssx9Q6XAS3 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ssx9Q6XAS3 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ssx9Q6XAS3 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ssx9Q6XAS3 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ssx9Q6XAS3 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ssx9Q6XAS3 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Ssx9Q6XAS3 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ssx9Q6XAS3 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ssx9Q6XAS3 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ssx9Q6XAS3 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ssx9Q6XAS3 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ssx9Q6XAS3 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ssx9Q6XAS3 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ssx9Q6XAS3 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ssx9Q6XAS3 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ssx9Q6XAS3 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ssx9Q6XAS3 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ssx9Q6XAS3 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ssx9Q6XAS3 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ssx9Q6XAS3 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ssx9Q6XAS3 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ssx9Q6XAS3 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ssx9Q6XAS3 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ssx9Q6XAS3 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ssx9Q6XAS3 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ssx9Q6XAS3 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ssx9Q6XAS3 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ssx9Q6XAS3 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ssx9Q6XAS3 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ssx9Q6XAS3 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ssx9Q6XAS3 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ssx9Q6XAS3 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ssx9Q6XAS3 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ssx9Q6XAS3 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ssx9Q6XAS3 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ssx9Q6XAS3 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ssx9Q6XAS3 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ssx9Q6XAS3 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ssx9Q6XAS3 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ssx9Q6XAS3 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ssx9Q6XAS3 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ssx9Q6XAS3 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ssx9Q6XAS3 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ssx9Q6XAS3 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ssx9Q6XAS3 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ssx9Q6XAS3 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Ssx9Q6XAS3 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ssx9Q6XAS3 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ssx9Q6XAS3 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ssx9Q6XAS3 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ssx9Q6XAS3 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ssx9Q6XAS3 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.27
Ssx9Q6XAS3 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC13.4□□□□□ -0.27
Ssx9Q6XAS3 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ssx9Q6XAS3 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ssx9Q6XAS3 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ssx9Q6XAS3 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ssx9Q6XAS3 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ssx9Q6XAS3 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ssx9Q6XAS3 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ssx9Q6XAS3 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ssx9Q6XAS3 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ssx9Q6XAS3 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ssx9Q6XAS3 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Ssx9Q6XAS3 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ssx9Q6XAS3 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ssx9Q6XAS3 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Ssx9Q6XAS3 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ssx9Q6XAS3 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Ssx9Q6XAS3 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ssx9Q6XAS3 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ssx9Q6XAS3 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ssx9Q6XAS3 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ssx9Q6XAS3 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ssx9Q6XAS3 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ssx9Q6XAS3 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ssx9Q6XAS3 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ssx9Q6XAS3 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Ssx9Q6XAS3 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ssx9Q6XAS3 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ssx9Q6XAS3 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ssx9Q6XAS3 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ssx9Q6XAS3 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ssx9Q6XAS3 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ssx9Q6XAS3 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ssx9Q6XAS3 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ssx9Q6XAS3 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ssx9Q6XAS3 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ssx9Q6XAS3 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ssx9Q6XAS3 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ssx9Q6XAS3 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ssx9Q6XAS3 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ssx9Q6XAS3 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ssx9Q6XAS3 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ssx9Q6XAS3 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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