Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCX9

Trim37, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM37, mousemouse

Predictions only

Length 961 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim37Q6PCX9 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trim37Q6PCX9 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trim37Q6PCX9 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Trim37Q6PCX9 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trim37Q6PCX9 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trim37Q6PCX9 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trim37Q6PCX9 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trim37Q6PCX9 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trim37Q6PCX9 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trim37Q6PCX9 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trim37Q6PCX9 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trim37Q6PCX9 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trim37Q6PCX9 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trim37Q6PCX9 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trim37Q6PCX9 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trim37Q6PCX9 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trim37Q6PCX9 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trim37Q6PCX9 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trim37Q6PCX9 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trim37Q6PCX9 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Trim37Q6PCX9 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Trim37Q6PCX9 Nkx2-2os-202ENSMUST00000184407 458 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Trim37Q6PCX9 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trim37Q6PCX9 Rpl7a-ps10-201ENSMUST00000190579 798 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Trim37Q6PCX9 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Trim37Q6PCX9 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trim37Q6PCX9 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Trim37Q6PCX9 CT573034.1-201ENSMUST00000222983 313 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Trim37Q6PCX9 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trim37Q6PCX9 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Trim37Q6PCX9 Rpl7a-ps5-201ENSMUST00000095218 807 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trim37Q6PCX9 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trim37Q6PCX9 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trim37Q6PCX9 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trim37Q6PCX9 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trim37Q6PCX9 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Trim37Q6PCX9 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trim37Q6PCX9 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trim37Q6PCX9 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trim37Q6PCX9 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trim37Q6PCX9 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Trim37Q6PCX9 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trim37Q6PCX9 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trim37Q6PCX9 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trim37Q6PCX9 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trim37Q6PCX9 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trim37Q6PCX9 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trim37Q6PCX9 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trim37Q6PCX9 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trim37Q6PCX9 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trim37Q6PCX9 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trim37Q6PCX9 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Trim37Q6PCX9 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trim37Q6PCX9 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trim37Q6PCX9 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trim37Q6PCX9 Gm17111-201ENSMUST00000169981 411 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Trim37Q6PCX9 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trim37Q6PCX9 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Trim37Q6PCX9 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trim37Q6PCX9 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Trim37Q6PCX9 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Trim37Q6PCX9 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trim37Q6PCX9 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trim37Q6PCX9 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trim37Q6PCX9 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trim37Q6PCX9 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trim37Q6PCX9 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Trim37Q6PCX9 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Trim37Q6PCX9 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Trim37Q6PCX9 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Trim37Q6PCX9 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Trim37Q6PCX9 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Trim37Q6PCX9 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim37Q6PCX9 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim37Q6PCX9 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim37Q6PCX9 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim37Q6PCX9 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim37Q6PCX9 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim37Q6PCX9 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim37Q6PCX9 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim37Q6PCX9 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim37Q6PCX9 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim37Q6PCX9 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim37Q6PCX9 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim37Q6PCX9 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim37Q6PCX9 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim37Q6PCX9 Pdlim2-204ENSMUST00000127836 920 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim37Q6PCX9 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim37Q6PCX9 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim37Q6PCX9 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim37Q6PCX9 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim37Q6PCX9 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
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