Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU5

Cltb, Clathrin light chain B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CltbQ6IRU5 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
CltbQ6IRU5 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
CltbQ6IRU5 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
CltbQ6IRU5 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
CltbQ6IRU5 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
CltbQ6IRU5 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
CltbQ6IRU5 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
CltbQ6IRU5 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
CltbQ6IRU5 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
CltbQ6IRU5 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
CltbQ6IRU5 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
CltbQ6IRU5 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
CltbQ6IRU5 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
CltbQ6IRU5 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
CltbQ6IRU5 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
CltbQ6IRU5 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
CltbQ6IRU5 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC12.41□□□□□ -0.42
CltbQ6IRU5 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
CltbQ6IRU5 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
CltbQ6IRU5 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
CltbQ6IRU5 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
CltbQ6IRU5 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
CltbQ6IRU5 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
CltbQ6IRU5 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
CltbQ6IRU5 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
CltbQ6IRU5 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
CltbQ6IRU5 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
CltbQ6IRU5 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
CltbQ6IRU5 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
CltbQ6IRU5 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
CltbQ6IRU5 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
CltbQ6IRU5 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
CltbQ6IRU5 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
CltbQ6IRU5 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
CltbQ6IRU5 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
CltbQ6IRU5 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
CltbQ6IRU5 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
CltbQ6IRU5 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
CltbQ6IRU5 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
CltbQ6IRU5 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
CltbQ6IRU5 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
CltbQ6IRU5 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
CltbQ6IRU5 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
CltbQ6IRU5 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
CltbQ6IRU5 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC12.4□□□□□ -0.42
CltbQ6IRU5 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
CltbQ6IRU5 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
CltbQ6IRU5 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
CltbQ6IRU5 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
CltbQ6IRU5 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
CltbQ6IRU5 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
CltbQ6IRU5 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
CltbQ6IRU5 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
CltbQ6IRU5 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
CltbQ6IRU5 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
CltbQ6IRU5 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
CltbQ6IRU5 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
CltbQ6IRU5 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
CltbQ6IRU5 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
CltbQ6IRU5 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
CltbQ6IRU5 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC12.4□□□□□ -0.42
CltbQ6IRU5 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
CltbQ6IRU5 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
CltbQ6IRU5 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
CltbQ6IRU5 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
CltbQ6IRU5 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
CltbQ6IRU5 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
CltbQ6IRU5 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
CltbQ6IRU5 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
CltbQ6IRU5 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
CltbQ6IRU5 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
CltbQ6IRU5 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
CltbQ6IRU5 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC12.4□□□□□ -0.42
CltbQ6IRU5 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
CltbQ6IRU5 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
CltbQ6IRU5 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
CltbQ6IRU5 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
CltbQ6IRU5 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
CltbQ6IRU5 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
CltbQ6IRU5 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
CltbQ6IRU5 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
CltbQ6IRU5 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
CltbQ6IRU5 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
CltbQ6IRU5 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
CltbQ6IRU5 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
CltbQ6IRU5 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
CltbQ6IRU5 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
CltbQ6IRU5 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
CltbQ6IRU5 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
CltbQ6IRU5 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
CltbQ6IRU5 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
CltbQ6IRU5 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
CltbQ6IRU5 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
CltbQ6IRU5 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
CltbQ6IRU5 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
CltbQ6IRU5 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
CltbQ6IRU5 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
CltbQ6IRU5 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
CltbQ6IRU5 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
CltbQ6IRU5 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.8 ms