Protein–RNA interactions for Protein: Q61398

Pcolce, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, mousemouse

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Length 468 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcolceQ61398 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
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PcolceQ61398 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
PcolceQ61398 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PcolceQ61398 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
PcolceQ61398 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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PcolceQ61398 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PcolceQ61398 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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PcolceQ61398 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
PcolceQ61398 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
PcolceQ61398 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
PcolceQ61398 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.55
PcolceQ61398 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms