Protein–RNA interactions for Protein: Q60520

Sin3a, Paired amphipathic helix protein Sin3a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sin3aQ60520 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Sin3aQ60520 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Sin3aQ60520 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Sin3aQ60520 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Sin3aQ60520 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Sin3aQ60520 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Sin3aQ60520 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Sin3aQ60520 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Sin3aQ60520 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Sin3aQ60520 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Sin3aQ60520 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Sin3aQ60520 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Sin3aQ60520 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Sin3aQ60520 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Sin3aQ60520 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Sin3aQ60520 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Sin3aQ60520 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Sin3aQ60520 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Sin3aQ60520 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Sin3aQ60520 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Sin3aQ60520 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Sin3aQ60520 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Sin3aQ60520 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Sin3aQ60520 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Sin3aQ60520 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Sin3aQ60520 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Sin3aQ60520 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Sin3aQ60520 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Sin3aQ60520 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Sin3aQ60520 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Sin3aQ60520 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Sin3aQ60520 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sin3aQ60520 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sin3aQ60520 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sin3aQ60520 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sin3aQ60520 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sin3aQ60520 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sin3aQ60520 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sin3aQ60520 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Sin3aQ60520 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sin3aQ60520 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sin3aQ60520 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Sin3aQ60520 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Sin3aQ60520 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Sin3aQ60520 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sin3aQ60520 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sin3aQ60520 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sin3aQ60520 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sin3aQ60520 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sin3aQ60520 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sin3aQ60520 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sin3aQ60520 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Sin3aQ60520 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sin3aQ60520 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sin3aQ60520 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sin3aQ60520 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sin3aQ60520 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sin3aQ60520 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sin3aQ60520 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sin3aQ60520 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sin3aQ60520 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sin3aQ60520 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sin3aQ60520 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sin3aQ60520 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sin3aQ60520 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sin3aQ60520 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sin3aQ60520 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sin3aQ60520 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sin3aQ60520 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sin3aQ60520 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sin3aQ60520 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sin3aQ60520 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sin3aQ60520 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sin3aQ60520 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sin3aQ60520 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sin3aQ60520 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sin3aQ60520 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sin3aQ60520 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sin3aQ60520 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Sin3aQ60520 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sin3aQ60520 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Sin3aQ60520 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sin3aQ60520 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sin3aQ60520 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sin3aQ60520 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sin3aQ60520 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sin3aQ60520 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sin3aQ60520 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sin3aQ60520 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sin3aQ60520 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sin3aQ60520 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sin3aQ60520 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sin3aQ60520 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sin3aQ60520 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sin3aQ60520 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sin3aQ60520 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sin3aQ60520 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sin3aQ60520 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sin3aQ60520 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sin3aQ60520 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms