Protein–RNA interactions for Protein: Q5SV85

Synrg, Synergin gamma, mousemouse

Predictions only

Length 1,306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SynrgQ5SV85 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SynrgQ5SV85 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SynrgQ5SV85 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SynrgQ5SV85 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SynrgQ5SV85 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SynrgQ5SV85 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SynrgQ5SV85 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SynrgQ5SV85 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SynrgQ5SV85 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SynrgQ5SV85 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SynrgQ5SV85 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SynrgQ5SV85 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SynrgQ5SV85 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SynrgQ5SV85 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SynrgQ5SV85 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SynrgQ5SV85 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SynrgQ5SV85 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SynrgQ5SV85 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SynrgQ5SV85 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SynrgQ5SV85 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SynrgQ5SV85 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SynrgQ5SV85 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SynrgQ5SV85 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SynrgQ5SV85 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SynrgQ5SV85 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SynrgQ5SV85 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SynrgQ5SV85 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SynrgQ5SV85 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SynrgQ5SV85 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SynrgQ5SV85 Tm2d2-202ENSMUST00000210536 727 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SynrgQ5SV85 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SynrgQ5SV85 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SynrgQ5SV85 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SynrgQ5SV85 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SynrgQ5SV85 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SynrgQ5SV85 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SynrgQ5SV85 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SynrgQ5SV85 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SynrgQ5SV85 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SynrgQ5SV85 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SynrgQ5SV85 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SynrgQ5SV85 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SynrgQ5SV85 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SynrgQ5SV85 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SynrgQ5SV85 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SynrgQ5SV85 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SynrgQ5SV85 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SynrgQ5SV85 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SynrgQ5SV85 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SynrgQ5SV85 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SynrgQ5SV85 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SynrgQ5SV85 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SynrgQ5SV85 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SynrgQ5SV85 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SynrgQ5SV85 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SynrgQ5SV85 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SynrgQ5SV85 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SynrgQ5SV85 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SynrgQ5SV85 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SynrgQ5SV85 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SynrgQ5SV85 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SynrgQ5SV85 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SynrgQ5SV85 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SynrgQ5SV85 Mir7070-201ENSMUST00000183657 86 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SynrgQ5SV85 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SynrgQ5SV85 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SynrgQ5SV85 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SynrgQ5SV85 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SynrgQ5SV85 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SynrgQ5SV85 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SynrgQ5SV85 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SynrgQ5SV85 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SynrgQ5SV85 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SynrgQ5SV85 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SynrgQ5SV85 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SynrgQ5SV85 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SynrgQ5SV85 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SynrgQ5SV85 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SynrgQ5SV85 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SynrgQ5SV85 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SynrgQ5SV85 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SynrgQ5SV85 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SynrgQ5SV85 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SynrgQ5SV85 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SynrgQ5SV85 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SynrgQ5SV85 Ewsr1-201ENSMUST00000063232 1320 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SynrgQ5SV85 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SynrgQ5SV85 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SynrgQ5SV85 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SynrgQ5SV85 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SynrgQ5SV85 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SynrgQ5SV85 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SynrgQ5SV85 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SynrgQ5SV85 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SynrgQ5SV85 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SynrgQ5SV85 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SynrgQ5SV85 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SynrgQ5SV85 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SynrgQ5SV85 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SynrgQ5SV85 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 93.4 ms