Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Sft2d1Q5SSN7 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Sft2d1Q5SSN7 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Sft2d1Q5SSN7 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Sft2d1Q5SSN7 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Sft2d1Q5SSN7 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Sft2d1Q5SSN7 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Sft2d1Q5SSN7 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Sft2d1Q5SSN7 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Sft2d1Q5SSN7 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Sft2d1Q5SSN7 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Sft2d1Q5SSN7 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Sft2d1Q5SSN7 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Sft2d1Q5SSN7 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Sft2d1Q5SSN7 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Sft2d1Q5SSN7 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Sft2d1Q5SSN7 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Sft2d1Q5SSN7 Camta2-205ENSMUST00000119120 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Sft2d1Q5SSN7 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Sft2d1Q5SSN7 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Sft2d1Q5SSN7 Jade2-203ENSMUST00000109091 6099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Sft2d1Q5SSN7 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Sft2d1Q5SSN7 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Sft2d1Q5SSN7 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Sft2d1Q5SSN7 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Sft2d1Q5SSN7 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Sft2d1Q5SSN7 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Sft2d1Q5SSN7 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Sft2d1Q5SSN7 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Sft2d1Q5SSN7 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Sft2d1Q5SSN7 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Sft2d1Q5SSN7 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Sft2d1Q5SSN7 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Sft2d1Q5SSN7 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Sft2d1Q5SSN7 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Sft2d1Q5SSN7 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Sft2d1Q5SSN7 Dpyd-201ENSMUST00000039177 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Sft2d1Q5SSN7 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Sft2d1Q5SSN7 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Sft2d1Q5SSN7 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Sft2d1Q5SSN7 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Sft2d1Q5SSN7 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Sft2d1Q5SSN7 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Sft2d1Q5SSN7 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Sft2d1Q5SSN7 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Sft2d1Q5SSN7 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Sft2d1Q5SSN7 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Sft2d1Q5SSN7 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Sft2d1Q5SSN7 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Sft2d1Q5SSN7 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Sft2d1Q5SSN7 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Sft2d1Q5SSN7 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Sft2d1Q5SSN7 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Sft2d1Q5SSN7 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Sft2d1Q5SSN7 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Sft2d1Q5SSN7 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Sft2d1Q5SSN7 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Sft2d1Q5SSN7 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Sft2d1Q5SSN7 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Sft2d1Q5SSN7 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Sft2d1Q5SSN7 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Sft2d1Q5SSN7 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Sft2d1Q5SSN7 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Sft2d1Q5SSN7 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Sft2d1Q5SSN7 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Sft2d1Q5SSN7 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Sft2d1Q5SSN7 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Sft2d1Q5SSN7 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Sft2d1Q5SSN7 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Sft2d1Q5SSN7 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Sft2d1Q5SSN7 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Sft2d1Q5SSN7 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Sft2d1Q5SSN7 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Sft2d1Q5SSN7 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Sft2d1Q5SSN7 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Sft2d1Q5SSN7 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Sft2d1Q5SSN7 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Sft2d1Q5SSN7 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Sft2d1Q5SSN7 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Sft2d1Q5SSN7 Ttbk2-202ENSMUST00000057135 11066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Sft2d1Q5SSN7 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Sft2d1Q5SSN7 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Sft2d1Q5SSN7 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Sft2d1Q5SSN7 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Sft2d1Q5SSN7 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Sft2d1Q5SSN7 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Sft2d1Q5SSN7 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Sft2d1Q5SSN7 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Sft2d1Q5SSN7 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Sft2d1Q5SSN7 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Sft2d1Q5SSN7 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Sft2d1Q5SSN7 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Sft2d1Q5SSN7 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Sft2d1Q5SSN7 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Sft2d1Q5SSN7 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Sft2d1Q5SSN7 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Sft2d1Q5SSN7 Rbm8a-202ENSMUST00000196456 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Sft2d1Q5SSN7 Rbm8a-206ENSMUST00000200647 2620 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Sft2d1Q5SSN7 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Sft2d1Q5SSN7 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.1 ms