Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSI6

Utp18, U3 small nucleolar RNA-associated protein 18 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp18Q5SSI6 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Utp18Q5SSI6 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Utp18Q5SSI6 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Utp18Q5SSI6 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Utp18Q5SSI6 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Utp18Q5SSI6 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Utp18Q5SSI6 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Utp18Q5SSI6 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Utp18Q5SSI6 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Utp18Q5SSI6 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Utp18Q5SSI6 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Utp18Q5SSI6 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Utp18Q5SSI6 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Utp18Q5SSI6 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Utp18Q5SSI6 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Utp18Q5SSI6 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Utp18Q5SSI6 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Utp18Q5SSI6 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Utp18Q5SSI6 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Utp18Q5SSI6 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Utp18Q5SSI6 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Utp18Q5SSI6 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Utp18Q5SSI6 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Utp18Q5SSI6 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Utp18Q5SSI6 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Utp18Q5SSI6 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Utp18Q5SSI6 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Utp18Q5SSI6 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Utp18Q5SSI6 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Utp18Q5SSI6 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Utp18Q5SSI6 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Utp18Q5SSI6 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Utp18Q5SSI6 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Utp18Q5SSI6 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Utp18Q5SSI6 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Utp18Q5SSI6 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Utp18Q5SSI6 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Utp18Q5SSI6 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Utp18Q5SSI6 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Utp18Q5SSI6 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Utp18Q5SSI6 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Utp18Q5SSI6 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Utp18Q5SSI6 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Utp18Q5SSI6 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Utp18Q5SSI6 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Utp18Q5SSI6 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Utp18Q5SSI6 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Utp18Q5SSI6 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Utp18Q5SSI6 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Utp18Q5SSI6 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Utp18Q5SSI6 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Utp18Q5SSI6 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Utp18Q5SSI6 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Utp18Q5SSI6 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Utp18Q5SSI6 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Utp18Q5SSI6 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Utp18Q5SSI6 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Utp18Q5SSI6 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Utp18Q5SSI6 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Utp18Q5SSI6 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Utp18Q5SSI6 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Utp18Q5SSI6 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Utp18Q5SSI6 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Utp18Q5SSI6 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Utp18Q5SSI6 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Utp18Q5SSI6 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Utp18Q5SSI6 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Utp18Q5SSI6 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Utp18Q5SSI6 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Utp18Q5SSI6 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Utp18Q5SSI6 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Utp18Q5SSI6 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Utp18Q5SSI6 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Utp18Q5SSI6 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Utp18Q5SSI6 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Utp18Q5SSI6 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Utp18Q5SSI6 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Utp18Q5SSI6 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Utp18Q5SSI6 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Utp18Q5SSI6 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Utp18Q5SSI6 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Utp18Q5SSI6 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Utp18Q5SSI6 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Utp18Q5SSI6 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Utp18Q5SSI6 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Utp18Q5SSI6 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Utp18Q5SSI6 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Utp18Q5SSI6 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Utp18Q5SSI6 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Utp18Q5SSI6 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Utp18Q5SSI6 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Utp18Q5SSI6 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Utp18Q5SSI6 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Utp18Q5SSI6 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Utp18Q5SSI6 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Utp18Q5SSI6 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Utp18Q5SSI6 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Utp18Q5SSI6 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Utp18Q5SSI6 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Utp18Q5SSI6 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms