Protein–RNA interactions for Protein: Q5HZG4

Taf3, Transcription initiation factor TFIID subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 932 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf3Q5HZG4 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Taf3Q5HZG4 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Taf3Q5HZG4 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Taf3Q5HZG4 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Taf3Q5HZG4 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Taf3Q5HZG4 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Taf3Q5HZG4 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Taf3Q5HZG4 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Taf3Q5HZG4 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Taf3Q5HZG4 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Taf3Q5HZG4 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Taf3Q5HZG4 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Taf3Q5HZG4 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Taf3Q5HZG4 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Taf3Q5HZG4 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Taf3Q5HZG4 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Taf3Q5HZG4 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ 0
Taf3Q5HZG4 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Taf3Q5HZG4 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Taf3Q5HZG4 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Taf3Q5HZG4 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Taf3Q5HZG4 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Taf3Q5HZG4 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Taf3Q5HZG4 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Taf3Q5HZG4 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Taf3Q5HZG4 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Taf3Q5HZG4 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Taf3Q5HZG4 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Taf3Q5HZG4 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Taf3Q5HZG4 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Taf3Q5HZG4 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Taf3Q5HZG4 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Taf3Q5HZG4 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Taf3Q5HZG4 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Taf3Q5HZG4 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Taf3Q5HZG4 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Taf3Q5HZG4 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Taf3Q5HZG4 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Taf3Q5HZG4 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Taf3Q5HZG4 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Taf3Q5HZG4 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Taf3Q5HZG4 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Taf3Q5HZG4 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Taf3Q5HZG4 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Taf3Q5HZG4 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Taf3Q5HZG4 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Taf3Q5HZG4 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Taf3Q5HZG4 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Taf3Q5HZG4 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Taf3Q5HZG4 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Taf3Q5HZG4 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Taf3Q5HZG4 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Taf3Q5HZG4 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Taf3Q5HZG4 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Taf3Q5HZG4 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Taf3Q5HZG4 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Taf3Q5HZG4 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Taf3Q5HZG4 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Taf3Q5HZG4 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Taf3Q5HZG4 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Taf3Q5HZG4 Adamts5-201ENSMUST00000023611 8091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Taf3Q5HZG4 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Taf3Q5HZG4 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Taf3Q5HZG4 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Taf3Q5HZG4 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Taf3Q5HZG4 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Taf3Q5HZG4 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Taf3Q5HZG4 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Taf3Q5HZG4 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Taf3Q5HZG4 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Taf3Q5HZG4 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Taf3Q5HZG4 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Taf3Q5HZG4 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Taf3Q5HZG4 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Taf3Q5HZG4 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Taf3Q5HZG4 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Taf3Q5HZG4 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Taf3Q5HZG4 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Taf3Q5HZG4 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Taf3Q5HZG4 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Taf3Q5HZG4 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Taf3Q5HZG4 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Taf3Q5HZG4 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Taf3Q5HZG4 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Taf3Q5HZG4 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Taf3Q5HZG4 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Taf3Q5HZG4 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.03■□□□□ -0
Taf3Q5HZG4 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Taf3Q5HZG4 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Taf3Q5HZG4 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Taf3Q5HZG4 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Taf3Q5HZG4 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Taf3Q5HZG4 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Taf3Q5HZG4 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Taf3Q5HZG4 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Taf3Q5HZG4 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Taf3Q5HZG4 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Taf3Q5HZG4 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Taf3Q5HZG4 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Taf3Q5HZG4 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms