Protein–RNA interactions for Protein: Q3V3V9

Carmil2, Capping protein, Arp2/3 and myosin-I linker protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Carmil2Q3V3V9 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Carmil2Q3V3V9 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Carmil2Q3V3V9 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Carmil2Q3V3V9 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Carmil2Q3V3V9 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Carmil2Q3V3V9 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Carmil2Q3V3V9 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Carmil2Q3V3V9 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Carmil2Q3V3V9 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Carmil2Q3V3V9 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Carmil2Q3V3V9 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Carmil2Q3V3V9 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Carmil2Q3V3V9 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Carmil2Q3V3V9 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Carmil2Q3V3V9 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Carmil2Q3V3V9 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Carmil2Q3V3V9 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Carmil2Q3V3V9 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Carmil2Q3V3V9 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Carmil2Q3V3V9 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Carmil2Q3V3V9 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Carmil2Q3V3V9 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Carmil2Q3V3V9 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Carmil2Q3V3V9 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Carmil2Q3V3V9 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Carmil2Q3V3V9 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Carmil2Q3V3V9 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Carmil2Q3V3V9 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Carmil2Q3V3V9 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Carmil2Q3V3V9 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Carmil2Q3V3V9 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Carmil2Q3V3V9 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Carmil2Q3V3V9 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Carmil2Q3V3V9 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Carmil2Q3V3V9 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Carmil2Q3V3V9 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Carmil2Q3V3V9 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Carmil2Q3V3V9 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Carmil2Q3V3V9 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Carmil2Q3V3V9 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Carmil2Q3V3V9 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Carmil2Q3V3V9 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Carmil2Q3V3V9 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Carmil2Q3V3V9 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Carmil2Q3V3V9 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Carmil2Q3V3V9 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Carmil2Q3V3V9 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Carmil2Q3V3V9 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Carmil2Q3V3V9 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Carmil2Q3V3V9 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Carmil2Q3V3V9 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Carmil2Q3V3V9 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Carmil2Q3V3V9 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Carmil2Q3V3V9 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Carmil2Q3V3V9 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Carmil2Q3V3V9 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Carmil2Q3V3V9 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Carmil2Q3V3V9 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Carmil2Q3V3V9 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Carmil2Q3V3V9 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Carmil2Q3V3V9 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Carmil2Q3V3V9 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Carmil2Q3V3V9 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Carmil2Q3V3V9 Pdlim2-204ENSMUST00000127836 920 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Carmil2Q3V3V9 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Carmil2Q3V3V9 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Carmil2Q3V3V9 Dleu2-205ENSMUST00000182325 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Carmil2Q3V3V9 Dleu2-212ENSMUST00000183079 535 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Carmil2Q3V3V9 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Carmil2Q3V3V9 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Carmil2Q3V3V9 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Carmil2Q3V3V9 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Carmil2Q3V3V9 Ewsr1-201ENSMUST00000063232 1320 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Carmil2Q3V3V9 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Carmil2Q3V3V9 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Carmil2Q3V3V9 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Carmil2Q3V3V9 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Carmil2Q3V3V9 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Carmil2Q3V3V9 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Carmil2Q3V3V9 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Carmil2Q3V3V9 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Carmil2Q3V3V9 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Carmil2Q3V3V9 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Carmil2Q3V3V9 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Carmil2Q3V3V9 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Carmil2Q3V3V9 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Carmil2Q3V3V9 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Carmil2Q3V3V9 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Carmil2Q3V3V9 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Carmil2Q3V3V9 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Carmil2Q3V3V9 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Carmil2Q3V3V9 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Carmil2Q3V3V9 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Carmil2Q3V3V9 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Carmil2Q3V3V9 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Carmil2Q3V3V9 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Carmil2Q3V3V9 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Carmil2Q3V3V9 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Carmil2Q3V3V9 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Carmil2Q3V3V9 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.3 ms