Protein–RNA interactions for Protein: Q3UUY6

Prom2, Prominin-2, mousemouse

Predictions only

Length 835 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prom2Q3UUY6 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Prom2Q3UUY6 AC154849.4-201ENSMUST00000224868 365 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Prom2Q3UUY6 Lcn6-201ENSMUST00000059693 1254 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prom2Q3UUY6 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Prom2Q3UUY6 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prom2Q3UUY6 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prom2Q3UUY6 Fcna-201ENSMUST00000028307 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prom2Q3UUY6 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prom2Q3UUY6 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Prom2Q3UUY6 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prom2Q3UUY6 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Prom2Q3UUY6 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prom2Q3UUY6 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prom2Q3UUY6 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prom2Q3UUY6 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prom2Q3UUY6 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prom2Q3UUY6 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prom2Q3UUY6 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prom2Q3UUY6 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prom2Q3UUY6 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Prom2Q3UUY6 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Prom2Q3UUY6 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Prom2Q3UUY6 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Prom2Q3UUY6 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Prom2Q3UUY6 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Prom2Q3UUY6 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Prom2Q3UUY6 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Prom2Q3UUY6 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Prom2Q3UUY6 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prom2Q3UUY6 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prom2Q3UUY6 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prom2Q3UUY6 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prom2Q3UUY6 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prom2Q3UUY6 Gm13296-201ENSMUST00000117854 997 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Prom2Q3UUY6 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prom2Q3UUY6 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prom2Q3UUY6 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prom2Q3UUY6 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prom2Q3UUY6 Gm34045-201ENSMUST00000217700 988 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prom2Q3UUY6 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prom2Q3UUY6 Ntng1-201ENSMUST00000051253 327 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Prom2Q3UUY6 Apc-201ENSMUST00000066133 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prom2Q3UUY6 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prom2Q3UUY6 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prom2Q3UUY6 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prom2Q3UUY6 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prom2Q3UUY6 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prom2Q3UUY6 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prom2Q3UUY6 Gm11924-201ENSMUST00000152306 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prom2Q3UUY6 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prom2Q3UUY6 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prom2Q3UUY6 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prom2Q3UUY6 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Prom2Q3UUY6 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prom2Q3UUY6 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prom2Q3UUY6 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prom2Q3UUY6 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Prom2Q3UUY6 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prom2Q3UUY6 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prom2Q3UUY6 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prom2Q3UUY6 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prom2Q3UUY6 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prom2Q3UUY6 Ctrc-202ENSMUST00000105781 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prom2Q3UUY6 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prom2Q3UUY6 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prom2Q3UUY6 Gm45219-201ENSMUST00000205602 465 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Prom2Q3UUY6 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Prom2Q3UUY6 AC166992.1-201ENSMUST00000216356 565 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Prom2Q3UUY6 AC101677.2-201ENSMUST00000218733 741 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prom2Q3UUY6 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Prom2Q3UUY6 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prom2Q3UUY6 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prom2Q3UUY6 Olfr398-201ENSMUST00000053874 945 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prom2Q3UUY6 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prom2Q3UUY6 Nudt7-201ENSMUST00000066514 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prom2Q3UUY6 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prom2Q3UUY6 Cd320-202ENSMUST00000087559 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prom2Q3UUY6 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prom2Q3UUY6 Gm26540-201ENSMUST00000181858 1310 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prom2Q3UUY6 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prom2Q3UUY6 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prom2Q3UUY6 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prom2Q3UUY6 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prom2Q3UUY6 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prom2Q3UUY6 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prom2Q3UUY6 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prom2Q3UUY6 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prom2Q3UUY6 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prom2Q3UUY6 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prom2Q3UUY6 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prom2Q3UUY6 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prom2Q3UUY6 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prom2Q3UUY6 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prom2Q3UUY6 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prom2Q3UUY6 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Prom2Q3UUY6 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prom2Q3UUY6 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prom2Q3UUY6 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prom2Q3UUY6 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prom2Q3UUY6 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms