Protein–RNA interactions for Protein: Q3U827

Rnf180, E3 ubiquitin-protein ligase RNF180, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf180Q3U827 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rnf180Q3U827 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rnf180Q3U827 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rnf180Q3U827 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rnf180Q3U827 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rnf180Q3U827 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rnf180Q3U827 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rnf180Q3U827 Gstm4-202ENSMUST00000106670 777 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rnf180Q3U827 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rnf180Q3U827 Gm15573-201ENSMUST00000119487 540 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Rnf180Q3U827 Gm12036-201ENSMUST00000120008 530 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Rnf180Q3U827 Dnmt3bos-201ENSMUST00000124988 718 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rnf180Q3U827 Tmem40-206ENSMUST00000170625 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rnf180Q3U827 Znrd1-202ENSMUST00000172518 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rnf180Q3U827 Gm18038-201ENSMUST00000197900 485 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Rnf180Q3U827 Gm4482-201ENSMUST00000200876 742 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Rnf180Q3U827 Gm44759-201ENSMUST00000206057 430 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rnf180Q3U827 AC166341.2-201ENSMUST00000220571 120 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Rnf180Q3U827 CT010486.3-201ENSMUST00000224555 811 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Rnf180Q3U827 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rnf180Q3U827 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rnf180Q3U827 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rnf180Q3U827 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rnf180Q3U827 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rnf180Q3U827 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rnf180Q3U827 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rnf180Q3U827 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rnf180Q3U827 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rnf180Q3U827 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rnf180Q3U827 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rnf180Q3U827 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rnf180Q3U827 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rnf180Q3U827 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rnf180Q3U827 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rnf180Q3U827 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rnf180Q3U827 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rnf180Q3U827 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rnf180Q3U827 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rnf180Q3U827 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rnf180Q3U827 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rnf180Q3U827 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rnf180Q3U827 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rnf180Q3U827 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rnf180Q3U827 Ypel4-201ENSMUST00000090729 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rnf180Q3U827 Gm7568-202ENSMUST00000160446 709 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
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Rnf180Q3U827 Gm9962-201ENSMUST00000085241 321 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rnf180Q3U827 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rnf180Q3U827 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rnf180Q3U827 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rnf180Q3U827 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf180Q3U827 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf180Q3U827 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf180Q3U827 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf180Q3U827 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
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Rnf180Q3U827 Smco2-201ENSMUST00000032433 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
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Rnf180Q3U827 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf180Q3U827 Art3-203ENSMUST00000118106 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf180Q3U827 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf180Q3U827 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf180Q3U827 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf180Q3U827 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf180Q3U827 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf180Q3U827 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf180Q3U827 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf180Q3U827 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf180Q3U827 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf180Q3U827 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf180Q3U827 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf180Q3U827 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf180Q3U827 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf180Q3U827 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf180Q3U827 Vbp1-202ENSMUST00000114070 632 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf180Q3U827 Gm14585-201ENSMUST00000120713 634 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf180Q3U827 Lmo3-202ENSMUST00000161450 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf180Q3U827 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf180Q3U827 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf180Q3U827 Gm28778-201ENSMUST00000190734 785 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf180Q3U827 Shisa5-205ENSMUST00000197099 742 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf180Q3U827 Gm18204-201ENSMUST00000209835 793 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf180Q3U827 AC122408.1-201ENSMUST00000218949 218 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf180Q3U827 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf180Q3U827 Tas2r126-201ENSMUST00000059534 930 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf180Q3U827 Acot13-201ENSMUST00000006900 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf180Q3U827 n-R5s211-201ENSMUST00000093689 119 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf180Q3U827 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms