Protein–RNA interactions for Protein: Q3U3Q1

Ulk3, Serine/threonine-protein kinase ULK3, mousemouse

Predictions only

Length 472 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ulk3Q3U3Q1 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Ulk3Q3U3Q1 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ulk3Q3U3Q1 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ulk3Q3U3Q1 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ulk3Q3U3Q1 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ulk3Q3U3Q1 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ulk3Q3U3Q1 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ulk3Q3U3Q1 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ulk3Q3U3Q1 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ulk3Q3U3Q1 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ulk3Q3U3Q1 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ulk3Q3U3Q1 Ints6-202ENSMUST00000223585 10883 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ulk3Q3U3Q1 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ulk3Q3U3Q1 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ulk3Q3U3Q1 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Ulk3Q3U3Q1 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ulk3Q3U3Q1 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ulk3Q3U3Q1 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ulk3Q3U3Q1 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ulk3Q3U3Q1 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ulk3Q3U3Q1 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ulk3Q3U3Q1 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ulk3Q3U3Q1 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ulk3Q3U3Q1 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ulk3Q3U3Q1 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ulk3Q3U3Q1 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Ulk3Q3U3Q1 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ulk3Q3U3Q1 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ulk3Q3U3Q1 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ulk3Q3U3Q1 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ulk3Q3U3Q1 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ulk3Q3U3Q1 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ulk3Q3U3Q1 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ulk3Q3U3Q1 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ulk3Q3U3Q1 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ulk3Q3U3Q1 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ulk3Q3U3Q1 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ulk3Q3U3Q1 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ulk3Q3U3Q1 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ulk3Q3U3Q1 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Ulk3Q3U3Q1 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Ulk3Q3U3Q1 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ulk3Q3U3Q1 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Ulk3Q3U3Q1 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ulk3Q3U3Q1 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Ulk3Q3U3Q1 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ulk3Q3U3Q1 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ulk3Q3U3Q1 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ulk3Q3U3Q1 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ulk3Q3U3Q1 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ulk3Q3U3Q1 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ulk3Q3U3Q1 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ulk3Q3U3Q1 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Ulk3Q3U3Q1 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ulk3Q3U3Q1 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ulk3Q3U3Q1 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ulk3Q3U3Q1 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ulk3Q3U3Q1 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ulk3Q3U3Q1 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ulk3Q3U3Q1 Usp24-201ENSMUST00000094933 10575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ulk3Q3U3Q1 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ulk3Q3U3Q1 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ulk3Q3U3Q1 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ulk3Q3U3Q1 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ulk3Q3U3Q1 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ulk3Q3U3Q1 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ulk3Q3U3Q1 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ulk3Q3U3Q1 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ulk3Q3U3Q1 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ulk3Q3U3Q1 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ulk3Q3U3Q1 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ulk3Q3U3Q1 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ulk3Q3U3Q1 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ulk3Q3U3Q1 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ulk3Q3U3Q1 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ulk3Q3U3Q1 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ulk3Q3U3Q1 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ulk3Q3U3Q1 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ulk3Q3U3Q1 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ulk3Q3U3Q1 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC13□□□□□ -0.33
Ulk3Q3U3Q1 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ulk3Q3U3Q1 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ulk3Q3U3Q1 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Ulk3Q3U3Q1 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ulk3Q3U3Q1 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ulk3Q3U3Q1 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ulk3Q3U3Q1 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Ulk3Q3U3Q1 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Ulk3Q3U3Q1 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ulk3Q3U3Q1 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ulk3Q3U3Q1 Jade2-203ENSMUST00000109091 6099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ulk3Q3U3Q1 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ulk3Q3U3Q1 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ulk3Q3U3Q1 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ulk3Q3U3Q1 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ulk3Q3U3Q1 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ulk3Q3U3Q1 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ulk3Q3U3Q1 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ulk3Q3U3Q1 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ulk3Q3U3Q1 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.6 ms