Protein–RNA interactions for Protein: Q3TRM4

Pnpla6, Neuropathy target esterase, mousemouse

Predictions only

Length 1,355 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pnpla6Q3TRM4 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pnpla6Q3TRM4 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pnpla6Q3TRM4 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pnpla6Q3TRM4 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pnpla6Q3TRM4 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pnpla6Q3TRM4 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pnpla6Q3TRM4 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pnpla6Q3TRM4 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pnpla6Q3TRM4 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pnpla6Q3TRM4 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pnpla6Q3TRM4 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pnpla6Q3TRM4 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Pnpla6Q3TRM4 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pnpla6Q3TRM4 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Pnpla6Q3TRM4 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pnpla6Q3TRM4 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Pnpla6Q3TRM4 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pnpla6Q3TRM4 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pnpla6Q3TRM4 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pnpla6Q3TRM4 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pnpla6Q3TRM4 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pnpla6Q3TRM4 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pnpla6Q3TRM4 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pnpla6Q3TRM4 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pnpla6Q3TRM4 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pnpla6Q3TRM4 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pnpla6Q3TRM4 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pnpla6Q3TRM4 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pnpla6Q3TRM4 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pnpla6Q3TRM4 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pnpla6Q3TRM4 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pnpla6Q3TRM4 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pnpla6Q3TRM4 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pnpla6Q3TRM4 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pnpla6Q3TRM4 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pnpla6Q3TRM4 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pnpla6Q3TRM4 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pnpla6Q3TRM4 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pnpla6Q3TRM4 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pnpla6Q3TRM4 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pnpla6Q3TRM4 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pnpla6Q3TRM4 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pnpla6Q3TRM4 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pnpla6Q3TRM4 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pnpla6Q3TRM4 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pnpla6Q3TRM4 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pnpla6Q3TRM4 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pnpla6Q3TRM4 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pnpla6Q3TRM4 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pnpla6Q3TRM4 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Pnpla6Q3TRM4 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Pnpla6Q3TRM4 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Pnpla6Q3TRM4 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pnpla6Q3TRM4 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pnpla6Q3TRM4 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pnpla6Q3TRM4 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pnpla6Q3TRM4 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Pnpla6Q3TRM4 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pnpla6Q3TRM4 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pnpla6Q3TRM4 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pnpla6Q3TRM4 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pnpla6Q3TRM4 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pnpla6Q3TRM4 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pnpla6Q3TRM4 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pnpla6Q3TRM4 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pnpla6Q3TRM4 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pnpla6Q3TRM4 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pnpla6Q3TRM4 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pnpla6Q3TRM4 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pnpla6Q3TRM4 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pnpla6Q3TRM4 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pnpla6Q3TRM4 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pnpla6Q3TRM4 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pnpla6Q3TRM4 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pnpla6Q3TRM4 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pnpla6Q3TRM4 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pnpla6Q3TRM4 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pnpla6Q3TRM4 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pnpla6Q3TRM4 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pnpla6Q3TRM4 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pnpla6Q3TRM4 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Pnpla6Q3TRM4 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Pnpla6Q3TRM4 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Pnpla6Q3TRM4 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Pnpla6Q3TRM4 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pnpla6Q3TRM4 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pnpla6Q3TRM4 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Pnpla6Q3TRM4 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Pnpla6Q3TRM4 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pnpla6Q3TRM4 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Pnpla6Q3TRM4 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pnpla6Q3TRM4 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Pnpla6Q3TRM4 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Pnpla6Q3TRM4 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Pnpla6Q3TRM4 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pnpla6Q3TRM4 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pnpla6Q3TRM4 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pnpla6Q3TRM4 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pnpla6Q3TRM4 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pnpla6Q3TRM4 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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