Protein–RNA interactions for Protein: Q08093

Cnn2, Calponin-2, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnn2Q08093 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cnn2Q08093 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cnn2Q08093 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cnn2Q08093 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cnn2Q08093 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cnn2Q08093 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cnn2Q08093 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cnn2Q08093 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cnn2Q08093 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cnn2Q08093 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cnn2Q08093 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cnn2Q08093 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cnn2Q08093 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cnn2Q08093 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Cnn2Q08093 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cnn2Q08093 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Cnn2Q08093 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Cnn2Q08093 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Cnn2Q08093 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cnn2Q08093 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cnn2Q08093 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Cnn2Q08093 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cnn2Q08093 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cnn2Q08093 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cnn2Q08093 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Cnn2Q08093 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cnn2Q08093 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cnn2Q08093 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cnn2Q08093 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cnn2Q08093 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cnn2Q08093 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cnn2Q08093 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cnn2Q08093 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cnn2Q08093 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cnn2Q08093 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cnn2Q08093 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cnn2Q08093 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cnn2Q08093 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cnn2Q08093 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cnn2Q08093 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cnn2Q08093 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cnn2Q08093 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cnn2Q08093 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cnn2Q08093 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cnn2Q08093 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cnn2Q08093 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Cnn2Q08093 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Cnn2Q08093 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cnn2Q08093 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Cnn2Q08093 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cnn2Q08093 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cnn2Q08093 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Cnn2Q08093 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cnn2Q08093 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cnn2Q08093 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Cnn2Q08093 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cnn2Q08093 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cnn2Q08093 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cnn2Q08093 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cnn2Q08093 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cnn2Q08093 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cnn2Q08093 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
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Cnn2Q08093 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cnn2Q08093 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
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Cnn2Q08093 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
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Cnn2Q08093 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cnn2Q08093 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Cnn2Q08093 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cnn2Q08093 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cnn2Q08093 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cnn2Q08093 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cnn2Q08093 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cnn2Q08093 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cnn2Q08093 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cnn2Q08093 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cnn2Q08093 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cnn2Q08093 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cnn2Q08093 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cnn2Q08093 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cnn2Q08093 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cnn2Q08093 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cnn2Q08093 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cnn2Q08093 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cnn2Q08093 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cnn2Q08093 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cnn2Q08093 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cnn2Q08093 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cnn2Q08093 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cnn2Q08093 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cnn2Q08093 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cnn2Q08093 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cnn2Q08093 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cnn2Q08093 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cnn2Q08093 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Cnn2Q08093 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.9 ms