Protein–RNA interactions for Protein: Q06348

Prrx2, Paired mesoderm homeobox protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrx2Q06348 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Prrx2Q06348 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Prrx2Q06348 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Prrx2Q06348 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Prrx2Q06348 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Prrx2Q06348 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Prrx2Q06348 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Prrx2Q06348 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Prrx2Q06348 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Prrx2Q06348 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Prrx2Q06348 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Prrx2Q06348 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Prrx2Q06348 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Prrx2Q06348 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Prrx2Q06348 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Prrx2Q06348 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Prrx2Q06348 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Prrx2Q06348 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Prrx2Q06348 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Prrx2Q06348 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Prrx2Q06348 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Prrx2Q06348 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Prrx2Q06348 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Prrx2Q06348 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Prrx2Q06348 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Prrx2Q06348 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Prrx2Q06348 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Prrx2Q06348 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Prrx2Q06348 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Prrx2Q06348 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Prrx2Q06348 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Prrx2Q06348 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Prrx2Q06348 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Prrx2Q06348 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Prrx2Q06348 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Prrx2Q06348 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Prrx2Q06348 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Prrx2Q06348 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Prrx2Q06348 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Prrx2Q06348 Gm22902-201ENSMUST00000158488 302 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Prrx2Q06348 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Prrx2Q06348 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Prrx2Q06348 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Prrx2Q06348 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Prrx2Q06348 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Prrx2Q06348 Gm16505-201ENSMUST00000179981 232 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Prrx2Q06348 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Prrx2Q06348 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Prrx2Q06348 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Prrx2Q06348 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Prrx2Q06348 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Prrx2Q06348 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Prrx2Q06348 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Prrx2Q06348 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Prrx2Q06348 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Prrx2Q06348 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Prrx2Q06348 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Prrx2Q06348 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Prrx2Q06348 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Prrx2Q06348 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Prrx2Q06348 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Prrx2Q06348 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Prrx2Q06348 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Prrx2Q06348 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Prrx2Q06348 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Prrx2Q06348 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Prrx2Q06348 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Prrx2Q06348 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Prrx2Q06348 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Prrx2Q06348 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Prrx2Q06348 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Prrx2Q06348 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Prrx2Q06348 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Prrx2Q06348 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Prrx2Q06348 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Prrx2Q06348 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Prrx2Q06348 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Prrx2Q06348 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Prrx2Q06348 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Prrx2Q06348 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Prrx2Q06348 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Prrx2Q06348 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Prrx2Q06348 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Prrx2Q06348 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Prrx2Q06348 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Prrx2Q06348 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Prrx2Q06348 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Prrx2Q06348 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Prrx2Q06348 Gm42791-202ENSMUST00000147473 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Prrx2Q06348 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Prrx2Q06348 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Prrx2Q06348 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Prrx2Q06348 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Prrx2Q06348 Nkx2-2os-202ENSMUST00000184407 458 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Prrx2Q06348 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Prrx2Q06348 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Prrx2Q06348 CT030182.1-201ENSMUST00000225935 533 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Prrx2Q06348 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Prrx2Q06348 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Prrx2Q06348 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms