Protein–RNA interactions for Protein: Q03402

Crisp3, Cysteine-rich secretory protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 241 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crisp3Q03402 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Crisp3Q03402 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Crisp3Q03402 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Crisp3Q03402 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Crisp3Q03402 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Crisp3Q03402 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Crisp3Q03402 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Crisp3Q03402 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Crisp3Q03402 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Crisp3Q03402 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Crisp3Q03402 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Crisp3Q03402 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Crisp3Q03402 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Crisp3Q03402 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Crisp3Q03402 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Crisp3Q03402 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Crisp3Q03402 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Crisp3Q03402 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Crisp3Q03402 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Crisp3Q03402 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Crisp3Q03402 Ptpn14-202ENSMUST00000097442 10746 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Crisp3Q03402 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Crisp3Q03402 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Crisp3Q03402 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Crisp3Q03402 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Crisp3Q03402 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Crisp3Q03402 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Crisp3Q03402 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Crisp3Q03402 Egfem1-202ENSMUST00000119598 2687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Crisp3Q03402 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Crisp3Q03402 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Crisp3Q03402 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Crisp3Q03402 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Crisp3Q03402 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Crisp3Q03402 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Crisp3Q03402 Htr2c-207ENSMUST00000156697 4654 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Crisp3Q03402 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Crisp3Q03402 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Crisp3Q03402 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Crisp3Q03402 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Crisp3Q03402 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Crisp3Q03402 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Crisp3Q03402 AC164426.2-201ENSMUST00000225993 2492 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Crisp3Q03402 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Crisp3Q03402 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Crisp3Q03402 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Crisp3Q03402 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Crisp3Q03402 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Crisp3Q03402 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Crisp3Q03402 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Crisp3Q03402 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Crisp3Q03402 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Crisp3Q03402 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Crisp3Q03402 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Crisp3Q03402 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Crisp3Q03402 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Crisp3Q03402 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Crisp3Q03402 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Crisp3Q03402 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Crisp3Q03402 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Crisp3Q03402 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Crisp3Q03402 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Crisp3Q03402 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Crisp3Q03402 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Crisp3Q03402 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Crisp3Q03402 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Crisp3Q03402 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Crisp3Q03402 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Crisp3Q03402 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Crisp3Q03402 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Crisp3Q03402 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Crisp3Q03402 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Crisp3Q03402 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Crisp3Q03402 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Crisp3Q03402 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Crisp3Q03402 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Crisp3Q03402 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Crisp3Q03402 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Crisp3Q03402 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Crisp3Q03402 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Crisp3Q03402 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Crisp3Q03402 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Crisp3Q03402 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Crisp3Q03402 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Crisp3Q03402 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Crisp3Q03402 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Crisp3Q03402 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Crisp3Q03402 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Crisp3Q03402 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Crisp3Q03402 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Crisp3Q03402 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Crisp3Q03402 Zbtb40-201ENSMUST00000049583 7192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Crisp3Q03402 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Crisp3Q03402 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Crisp3Q03402 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Crisp3Q03402 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Crisp3Q03402 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Crisp3Q03402 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Crisp3Q03402 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Crisp3Q03402 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms