Protein–RNA interactions for Protein: Q02739

Gjb5, Gap junction beta-5 protein, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb5Q02739 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gjb5Q02739 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gjb5Q02739 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gjb5Q02739 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gjb5Q02739 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gjb5Q02739 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gjb5Q02739 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Gjb5Q02739 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Gjb5Q02739 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gjb5Q02739 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Gjb5Q02739 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gjb5Q02739 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gjb5Q02739 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gjb5Q02739 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gjb5Q02739 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gjb5Q02739 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gjb5Q02739 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gjb5Q02739 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gjb5Q02739 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gjb5Q02739 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gjb5Q02739 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gjb5Q02739 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gjb5Q02739 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gjb5Q02739 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gjb5Q02739 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gjb5Q02739 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Gjb5Q02739 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gjb5Q02739 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gjb5Q02739 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gjb5Q02739 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gjb5Q02739 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gjb5Q02739 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gjb5Q02739 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gjb5Q02739 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gjb5Q02739 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Gjb5Q02739 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gjb5Q02739 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gjb5Q02739 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gjb5Q02739 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gjb5Q02739 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gjb5Q02739 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gjb5Q02739 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gjb5Q02739 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gjb5Q02739 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gjb5Q02739 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gjb5Q02739 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gjb5Q02739 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gjb5Q02739 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gjb5Q02739 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gjb5Q02739 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gjb5Q02739 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gjb5Q02739 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gjb5Q02739 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gjb5Q02739 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gjb5Q02739 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gjb5Q02739 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gjb5Q02739 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gjb5Q02739 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gjb5Q02739 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gjb5Q02739 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gjb5Q02739 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gjb5Q02739 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gjb5Q02739 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gjb5Q02739 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gjb5Q02739 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gjb5Q02739 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gjb5Q02739 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gjb5Q02739 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Gjb5Q02739 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gjb5Q02739 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Gjb5Q02739 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gjb5Q02739 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gjb5Q02739 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gjb5Q02739 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Gjb5Q02739 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Gjb5Q02739 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gjb5Q02739 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gjb5Q02739 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gjb5Q02739 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Gjb5Q02739 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gjb5Q02739 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Gjb5Q02739 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gjb5Q02739 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gjb5Q02739 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gjb5Q02739 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gjb5Q02739 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gjb5Q02739 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gjb5Q02739 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gjb5Q02739 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gjb5Q02739 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gjb5Q02739 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gjb5Q02739 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gjb5Q02739 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gjb5Q02739 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gjb5Q02739 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gjb5Q02739 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gjb5Q02739 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gjb5Q02739 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gjb5Q02739 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gjb5Q02739 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms