Protein–RNA interactions for Protein: Q02738

Gjb4, Gap junction beta-4 protein, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb4Q02738 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gjb4Q02738 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gjb4Q02738 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gjb4Q02738 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gjb4Q02738 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Gjb4Q02738 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Gjb4Q02738 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gjb4Q02738 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gjb4Q02738 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gjb4Q02738 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gjb4Q02738 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gjb4Q02738 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gjb4Q02738 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gjb4Q02738 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gjb4Q02738 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gjb4Q02738 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gjb4Q02738 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Gjb4Q02738 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gjb4Q02738 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gjb4Q02738 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gjb4Q02738 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gjb4Q02738 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gjb4Q02738 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gjb4Q02738 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gjb4Q02738 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gjb4Q02738 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gjb4Q02738 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gjb4Q02738 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gjb4Q02738 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gjb4Q02738 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gjb4Q02738 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gjb4Q02738 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gjb4Q02738 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Gjb4Q02738 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gjb4Q02738 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gjb4Q02738 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gjb4Q02738 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Gjb4Q02738 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gjb4Q02738 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gjb4Q02738 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gjb4Q02738 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gjb4Q02738 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gjb4Q02738 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gjb4Q02738 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gjb4Q02738 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gjb4Q02738 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gjb4Q02738 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gjb4Q02738 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gjb4Q02738 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gjb4Q02738 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gjb4Q02738 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gjb4Q02738 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gjb4Q02738 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gjb4Q02738 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gjb4Q02738 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gjb4Q02738 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gjb4Q02738 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gjb4Q02738 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gjb4Q02738 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gjb4Q02738 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gjb4Q02738 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gjb4Q02738 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gjb4Q02738 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gjb4Q02738 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gjb4Q02738 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Gjb4Q02738 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gjb4Q02738 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gjb4Q02738 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Gjb4Q02738 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Gjb4Q02738 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gjb4Q02738 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gjb4Q02738 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gjb4Q02738 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gjb4Q02738 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gjb4Q02738 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gjb4Q02738 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gjb4Q02738 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gjb4Q02738 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gjb4Q02738 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gjb4Q02738 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gjb4Q02738 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gjb4Q02738 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gjb4Q02738 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gjb4Q02738 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gjb4Q02738 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gjb4Q02738 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gjb4Q02738 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gjb4Q02738 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Gjb4Q02738 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gjb4Q02738 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gjb4Q02738 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gjb4Q02738 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Gjb4Q02738 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gjb4Q02738 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gjb4Q02738 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gjb4Q02738 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gjb4Q02738 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gjb4Q02738 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gjb4Q02738 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gjb4Q02738 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.8 ms