Protein–RNA interactions for Protein: Q01231

Gja5, Gap junction alpha-5 protein, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja5Q01231 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gja5Q01231 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Gja5Q01231 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gja5Q01231 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gja5Q01231 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gja5Q01231 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gja5Q01231 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Gja5Q01231 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gja5Q01231 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gja5Q01231 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gja5Q01231 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gja5Q01231 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gja5Q01231 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gja5Q01231 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gja5Q01231 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gja5Q01231 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Gja5Q01231 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gja5Q01231 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gja5Q01231 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gja5Q01231 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gja5Q01231 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gja5Q01231 Bnip3l-ps-201ENSMUST00000101577 657 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Gja5Q01231 Zfp157-203ENSMUST00000110912 886 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gja5Q01231 Cdk2ap1-204ENSMUST00000111474 1286 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gja5Q01231 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gja5Q01231 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gja5Q01231 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gja5Q01231 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Gja5Q01231 Gm45224-201ENSMUST00000208203 414 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Gja5Q01231 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gja5Q01231 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Gja5Q01231 Gm18556-201ENSMUST00000219748 1031 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Gja5Q01231 Bnip3l-ps-202ENSMUST00000220709 1132 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Gja5Q01231 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gja5Q01231 Gm8385-201ENSMUST00000058999 643 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Gja5Q01231 Batf2-201ENSMUST00000045042 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gja5Q01231 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gja5Q01231 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gja5Q01231 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gja5Q01231 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Gja5Q01231 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gja5Q01231 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gja5Q01231 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gja5Q01231 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gja5Q01231 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gja5Q01231 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gja5Q01231 Gm10787-201ENSMUST00000099552 1548 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gja5Q01231 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gja5Q01231 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gja5Q01231 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gja5Q01231 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Gja5Q01231 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gja5Q01231 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gja5Q01231 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gja5Q01231 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gja5Q01231 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gja5Q01231 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gja5Q01231 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Gja5Q01231 Lamr1-ps1-201ENSMUST00000119759 874 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Gja5Q01231 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gja5Q01231 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gja5Q01231 Gm8546-201ENSMUST00000178288 1264 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Gja5Q01231 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Gja5Q01231 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gja5Q01231 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gja5Q01231 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gja5Q01231 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gja5Q01231 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gja5Q01231 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gja5Q01231 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gja5Q01231 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gja5Q01231 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gja5Q01231 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gja5Q01231 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gja5Q01231 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gja5Q01231 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gja5Q01231 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gja5Q01231 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gja5Q01231 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gja5Q01231 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gja5Q01231 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gja5Q01231 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gja5Q01231 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gja5Q01231 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gja5Q01231 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gja5Q01231 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gja5Q01231 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gja5Q01231 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gja5Q01231 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gja5Q01231 1110038B12Rik-203ENSMUST00000173070 434 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gja5Q01231 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gja5Q01231 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gja5Q01231 Ccser2-208ENSMUST00000183007 1293 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gja5Q01231 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gja5Q01231 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gja5Q01231 AC154680.1-201ENSMUST00000224376 859 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Gja5Q01231 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Gja5Q01231 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gja5Q01231 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gja5Q01231 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.2 ms