Protein–RNA interactions for Protein: P70255

Nfic, Nuclear factor 1 C-type, mousemouse

Predictions only

Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NficP70255 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
NficP70255 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
NficP70255 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
NficP70255 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
NficP70255 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
NficP70255 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
NficP70255 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
NficP70255 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
NficP70255 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
NficP70255 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
NficP70255 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
NficP70255 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
NficP70255 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
NficP70255 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
NficP70255 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
NficP70255 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
NficP70255 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
NficP70255 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
NficP70255 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
NficP70255 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
NficP70255 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
NficP70255 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
NficP70255 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
NficP70255 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
NficP70255 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
NficP70255 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
NficP70255 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
NficP70255 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
NficP70255 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
NficP70255 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
NficP70255 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
NficP70255 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
NficP70255 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
NficP70255 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
NficP70255 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
NficP70255 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
NficP70255 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
NficP70255 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
NficP70255 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
NficP70255 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
NficP70255 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
NficP70255 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
NficP70255 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
NficP70255 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
NficP70255 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
NficP70255 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
NficP70255 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
NficP70255 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
NficP70255 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
NficP70255 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
NficP70255 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
NficP70255 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
NficP70255 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
NficP70255 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
NficP70255 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
NficP70255 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
NficP70255 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
NficP70255 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
NficP70255 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
NficP70255 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
NficP70255 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
NficP70255 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
NficP70255 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
NficP70255 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
NficP70255 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
NficP70255 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
NficP70255 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
NficP70255 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
NficP70255 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
NficP70255 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
NficP70255 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
NficP70255 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
NficP70255 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
NficP70255 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
NficP70255 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
NficP70255 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
NficP70255 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
NficP70255 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
NficP70255 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
NficP70255 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
NficP70255 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
NficP70255 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
NficP70255 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
NficP70255 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
NficP70255 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
NficP70255 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
NficP70255 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
NficP70255 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
NficP70255 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
NficP70255 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
NficP70255 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
NficP70255 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
NficP70255 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
NficP70255 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
NficP70255 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
NficP70255 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
NficP70255 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
NficP70255 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
NficP70255 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
NficP70255 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
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