Protein–RNA interactions for Protein: P62320

Snrpd3, Small nuclear ribonucleoprotein Sm D3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrpd3P62320 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Snrpd3P62320 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Snrpd3P62320 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Snrpd3P62320 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Snrpd3P62320 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Snrpd3P62320 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Snrpd3P62320 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Snrpd3P62320 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Snrpd3P62320 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Snrpd3P62320 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Snrpd3P62320 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Snrpd3P62320 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Snrpd3P62320 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Snrpd3P62320 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Snrpd3P62320 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Snrpd3P62320 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Snrpd3P62320 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Snrpd3P62320 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Snrpd3P62320 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Snrpd3P62320 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Snrpd3P62320 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Snrpd3P62320 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Snrpd3P62320 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Snrpd3P62320 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Snrpd3P62320 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Snrpd3P62320 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Snrpd3P62320 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Snrpd3P62320 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Snrpd3P62320 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Snrpd3P62320 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Snrpd3P62320 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Snrpd3P62320 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Snrpd3P62320 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Snrpd3P62320 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Snrpd3P62320 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Snrpd3P62320 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Snrpd3P62320 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Snrpd3P62320 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Snrpd3P62320 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Snrpd3P62320 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Snrpd3P62320 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Snrpd3P62320 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Snrpd3P62320 Myo18b-201ENSMUST00000086617 8280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Snrpd3P62320 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Snrpd3P62320 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Snrpd3P62320 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Snrpd3P62320 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Snrpd3P62320 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Snrpd3P62320 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Snrpd3P62320 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Snrpd3P62320 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Snrpd3P62320 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Snrpd3P62320 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Snrpd3P62320 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Snrpd3P62320 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Snrpd3P62320 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Snrpd3P62320 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Snrpd3P62320 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Snrpd3P62320 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Snrpd3P62320 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Snrpd3P62320 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Snrpd3P62320 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Snrpd3P62320 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Snrpd3P62320 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Snrpd3P62320 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Snrpd3P62320 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Snrpd3P62320 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Snrpd3P62320 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Snrpd3P62320 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Snrpd3P62320 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Snrpd3P62320 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Snrpd3P62320 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Snrpd3P62320 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Snrpd3P62320 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Snrpd3P62320 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Snrpd3P62320 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Snrpd3P62320 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Snrpd3P62320 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Snrpd3P62320 Frmd4a-202ENSMUST00000091497 6208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Snrpd3P62320 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Snrpd3P62320 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Snrpd3P62320 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Snrpd3P62320 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Snrpd3P62320 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Snrpd3P62320 Dab2ip-207ENSMUST00000112992 6184 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Snrpd3P62320 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Snrpd3P62320 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Snrpd3P62320 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Snrpd3P62320 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Snrpd3P62320 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Snrpd3P62320 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Snrpd3P62320 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Snrpd3P62320 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Snrpd3P62320 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Snrpd3P62320 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Snrpd3P62320 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Snrpd3P62320 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Snrpd3P62320 Cdk13-207ENSMUST00000223490 12548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Snrpd3P62320 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Snrpd3P62320 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms