Protein–RNA interactions for Protein: P56477

Irf5, Interferon regulatory factor 5, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf5P56477 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Irf5P56477 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Irf5P56477 Gm16275-201ENSMUST00000147774 712 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Irf5P56477 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Irf5P56477 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Irf5P56477 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Irf5P56477 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Irf5P56477 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Irf5P56477 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Irf5P56477 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Irf5P56477 Gm44044-201ENSMUST00000205178 1089 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Irf5P56477 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Irf5P56477 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Irf5P56477 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Irf5P56477 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Irf5P56477 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Irf5P56477 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Irf5P56477 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Irf5P56477 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Irf5P56477 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Irf5P56477 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Irf5P56477 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Irf5P56477 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Irf5P56477 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Irf5P56477 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Irf5P56477 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Irf5P56477 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Irf5P56477 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Irf5P56477 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Irf5P56477 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Irf5P56477 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Irf5P56477 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Irf5P56477 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Irf5P56477 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Irf5P56477 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Irf5P56477 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Irf5P56477 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Irf5P56477 G530012D18Rik-201ENSMUST00000178024 420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Irf5P56477 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Irf5P56477 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Irf5P56477 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Irf5P56477 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Irf5P56477 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Irf5P56477 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Irf5P56477 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Irf5P56477 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Irf5P56477 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Irf5P56477 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Irf5P56477 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Irf5P56477 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Irf5P56477 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Irf5P56477 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Irf5P56477 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Irf5P56477 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Irf5P56477 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Irf5P56477 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Irf5P56477 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Irf5P56477 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Irf5P56477 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Irf5P56477 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Irf5P56477 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Irf5P56477 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Irf5P56477 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Irf5P56477 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Irf5P56477 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Irf5P56477 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Irf5P56477 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Irf5P56477 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Irf5P56477 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Irf5P56477 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Irf5P56477 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Irf5P56477 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Irf5P56477 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Irf5P56477 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Irf5P56477 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Irf5P56477 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Irf5P56477 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Irf5P56477 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Irf5P56477 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Irf5P56477 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Irf5P56477 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Irf5P56477 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Irf5P56477 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Irf5P56477 Gm10652-201ENSMUST00000199790 2622 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Irf5P56477 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Irf5P56477 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Irf5P56477 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Irf5P56477 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Irf5P56477 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Irf5P56477 Gm3139-202ENSMUST00000201138 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Irf5P56477 Gm3183-203ENSMUST00000202911 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Irf5P56477 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Irf5P56477 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Irf5P56477 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Irf5P56477 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Irf5P56477 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Irf5P56477 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Irf5P56477 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Irf5P56477 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Irf5P56477 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms